金刚趁着自己还没被控制之前用尽全力拿起战斧冲了过去趁机杀晶体哥斯拉。
却被邪恶晶体哥斯拉察觉而控制金刚攻击哥斯拉的蛋！！自己和正义巨大哥斯拉的意识对抗！！
主角哥斯拉看着金刚不由自主缓缓的靠近，他对金刚微弱的吼一声要金刚离远一点，不要伤害蛋…
金刚不想的，但是他无法控制自己的行为，他拒绝就非常痛苦…他举起战斧对准主角哥斯拉身边的蛋…他仍然顽强抗拒，身体却不由自主在动…最后他大吼一声，仿佛在对主角哥斯拉说对不起，战斧高高举起，狠狠的砍下去了！！

战斧砍下，蛋却完好无损，因为一层坚固的蚕丝挡住了战斧的砍击…
摩斯拉从金刚和主角哥斯拉的上空飞过！！
巨大哥斯拉的意志压抑晶体哥斯拉的意志，他敞开胸口示意要金刚或摩斯拉杀了他！！
金刚恢复意识把战斧举高，摩斯拉停在战斧上，战斧吸收了摩斯拉散发出来磷光，磷光战斧蓄势待发，冲向晶体哥斯拉！！
晶体哥斯拉意志反扑巨大哥斯拉意志，掌控主导权，眼见金刚已经就几步之遥了，他急忙控制落在地上的巨刺反击！！
摩斯拉几口吐丝把巨刺和其他晶刺黏在地上，再吐一口粘住晶体哥斯拉的头。
晶体哥斯拉乱了方寸！！
金刚跃劈劈中晶体哥斯拉，然后连坏砍！！
晶体哥斯拉满身是伤一直退后，来一个电流爆发逼退金刚…
摩斯拉对着晶体哥斯拉声波攻击，扰乱心智，加上巨大哥斯拉意志还不停要反扑…
最后晶体哥斯拉只好化成巨大晶体飞走了…

晶体哥斯拉虽然逃跑了，但是长出来的晶体不停在地底世界扩张着…
摩斯拉先治疗主角哥斯拉和金刚，但是金刚体内的晶石无法取出…也就是说金刚可能还会被控制…
蜥蜴人和人类来到已经没有辐射的哥斯拉巢穴，没有废墟没有狼藉，只有一片平地和晶体…他们靠近金刚哥斯拉不远处被金刚示意阻止过来。
金刚告诉他们他被控制了，怕会伤害大家…
蜥蜴人地球意志已经侦查到晶体哥斯拉位置，晶体哥斯拉已经回到地表上某个岛的空中悬浮着接收能量。
同时地球枯萎加速了…从蜥蜴人他们现在所在的位置都可以明显看到…地面突然急速干燥了，花草树木枯萎了…
帝王组织传来消息，联盟军已经出发去消灭晶体哥斯拉，不过都是凶多吉少…
眼看地球加速灭亡中，人类绝望伤心和气愤…
蜥蜴人反而没绝望，目前晶体哥斯拉是不会炸掉地球的，因为他要将地球做为巢穴复制更多的晶体哥斯拉，但是当地球资源被他掏空后就不知道了…也许他会继续把地球当巢穴，将占据其它星球和吸收的能量出送到地球，就像高级文明的银河系那样…有一点人类要知道的，不过结果怎么样，地球已经不适合人类和其它生物居住在了，只会慢慢灭亡殆尽。
听下去还是一样绝望…
蜥蜴人选择地球居住之前也有很多可居住的星球选项，只是地球优先而已，现在很多蜥蜴人还是居住在其他可生存的星球上，蜥蜴人可以带人类离开地球去寻觅适合的星球生活。
人类气馁说近八十亿人口能全部移居其他星球？
不能，但是蜥蜴人至少可以带走部分人类，如各领域的尖子优先…
人类插口，还不是要牺牲大绝人…
蜥蜴人回答，庆幸人类不会灭绝，至少在座各位人类得到优先权。
人类无言…

人类还抱着希望，希望主角哥斯拉可以去消灭晶体哥斯拉…
蜥蜴人都摇头，他不看好，主角哥斯拉面对晶体哥斯拉根本不会全力以赴，这几场战斗看得很清楚…如果刚才毁灭性武器可以消灭晶体哥斯拉一切就结束了，不用对主角哥斯拉有期望…
人类越想越气，明知道晶体受控于晶体哥斯拉的，怎么会以晶体做成武器的核心？
蜥蜴人解释当初没有想过主导晶体还存在，而且这些遗留下来的晶体是经过修复记忆连接的让它变成独立个体…
…很明显晶体没有变独立个体，不然晶体哥斯拉不会在还没发射就察觉到了，还控制它大爆炸…
蜥蜴人认错，他们误判了…不过晶体确实是一个吸收和储存能量的最佳容器…
人类就在这时候发现，晶体记忆连接是可以修改？
蜥蜴人解释算可以，可以改掉晶体原本的连接，就像改掉网址或密码一样，所以当蜥蜴人启动毁灭性武器时，晶体哥斯拉是察觉到，但是他不能第一时间通过原本的连接轨迹控制大晶体来停止…而且相信他察觉到时候他无法认定大晶体是否隶属自己控制的晶体，蜥蜴人也发现当晶体哥斯拉夺回控制权引爆时，他注视着毁灭性武器很久因为他在搜索连接点…
从目前所得到的资讯，晶体核心虽然有控制其他生物的能力，但是在能量不足的情况下他就会失去控制能力…
他们回想起来确实如此，晶体哥斯拉能量越多控制能力就越大，吸走整个黑洞的能量足以控制高级文明银河系的所有晶体来自爆…
晶体提供能量给核心，核心却要消耗能量控制晶体，包括泰坦巨兽？晶石和晶体不一样，晶石比较特殊，晶石本身是吸收寄主的能量维持，寄主一旦死亡，晶石也会随着破灭…但是晶石破灭，寄主得到解脱！！不过随着核心再次来到地球后，那些被诅咒的暴走泰坦巨兽…蜥蜴人希望要更多的时间去了解…
等等！！记住一旦死亡，晶石就会随着破灭？蜥蜴人恍然大悟，这个就是为什么巨大哥斯拉要金刚杀了他…某个角度来讲，核心就是晶石，巨大哥斯拉就是寄主！！只要巨大哥斯拉死亡，核心也会随着被毁灭…但是晶体哥斯拉好像死了一次…低版哥斯拉炸死他了。
非也，现在晶体哥斯拉是另一头被复制出来的，他只是继承了死亡那一头的记忆档而已。
大家转望摩斯拉…摩斯拉诧异地看着大家…
懂了，除非在晶体哥斯拉还没有复制其它哥斯拉的情况下杀了他，他就会彻底消失！！
但是目前谁有能力杀死晶体哥斯拉呢？蜥蜴人看着在治疗的哥斯拉…也许就只剩下主角哥斯拉能办到…
还是算了…主角哥斯拉在晶体哥斯拉面前根本无法下死手…以之前主角哥斯拉的战斗力绝对胜于晶体哥斯拉，两次！！两次主角哥斯拉都因为下不了手而失败了…大家觉得第三次主角哥斯拉就可以吗？何况…现在的晶体哥斯拉的战斗力也许已经超越主角哥斯拉了…
大家有点失落…蜥蜴人还是决定去准备“诺亚方舟”，带大家离开地球…

当地底蜥蜴人要去建造诺亚方舟之际，帝王组织基地修复一开始地底蜥蜴人看了核心要统治宇宙那段先修复的核心损坏的记忆资料档已经完成了。
但是地底蜥蜴人已经觉得无关紧要了搁置一边，被抓蜥蜴人就接过修复好的记忆档和人类一起看。
原来是巨大哥斯拉和核心意识交锋的画面…巨大哥斯拉知道核心到达地球会做的事情后挣扎解脱核心的控制趁机夺回身躯主导权，企图在前往地球途中自爆阻止和了结一切！！
很快就被核心发现，意识里核心比较熟悉，很多就重新夺回身躯和把巨大哥斯拉的意识埋起来…
修复好的记忆还有最后孵化出来的巨大哥斯拉的记忆…原来低版哥斯拉炸死晶体哥斯拉后，核心意识受到重创而“昏迷了”失去主导权，孵化出来的巨大哥斯拉是空白的意识…盲目在洞穴里徘徊…直到人类出现…本能动了杀机，爆破组的火箭炮击中小型哥斯拉，沉睡巨大哥斯拉的意识醒来了，控制主导权，但是沉睡太久了…让巨大哥斯拉意识模糊，只有坚定的意志告诉他要回去地球，要守护巢穴…要见到主角哥斯拉…小哥斯拉…
小型哥斯拉离开洞穴后，和核心蛋断开连接…没记忆资料档了…

被抓蜥蜴人转望治疗中的主角哥斯拉…将部分得到的巨大哥斯拉记忆资料传送到一个手掌大的装置里，里面储存了关于大家看过的记忆资料档，然后走近主角哥斯拉的天灵盖，启动装置贴在主角哥斯拉的脑勺…
人类问这是什么？
被抓蜥蜴人告诉人类，这是一种意识记忆信息虚体传送装置，可以直接将晶体里得到的记忆资料都输送到主角哥斯拉的脑袋里，让主角哥斯拉看看巨大哥斯拉这些年怎么度过的，巨大哥斯拉的意愿是什么…让主角哥斯拉自己决定要怎么做…
在不远处躲在一边的地底蜥蜴人看着，他看来是没有放弃主角哥斯拉…也没有放弃挽救地球…

昏睡的主角哥斯拉在梦中以巨大哥斯拉的视角看到很多关于巨大哥斯拉的点点滴滴和想法，巨大哥斯拉看着小哥斯拉破茧而出的喜悦…
摆出严肃冷漠的样子要小哥斯拉跟在他的后面学习，却担心小哥斯拉出岔子的…
看着生气不再理睬巨大哥斯拉的小哥斯拉离去的背影，暗中却高兴小哥斯拉有所成长，不再需要依赖巨大哥斯拉也可以生存下去…
不理睬巨大哥斯拉的小哥斯拉期间，巨大哥斯拉都会暗中关注小哥斯拉的一举一动，感觉到小哥斯拉没有自己也可以勇敢生存下去，继承自己…
巢穴被入侵之后严格训练小哥斯拉，看到小哥斯拉的能力以后绝对会是自己之上，所以训练小哥斯拉辛苦却很高兴…
远古大战巨大哥斯拉在做出牺牲之前看着主角哥斯拉，除了和主角哥斯拉道别，也交托主角哥斯拉，保护地球、保护巢穴，以后交给主角哥斯拉了…
飞往地球的途中，巨大哥斯拉知道核心会对地球不利，乘机夺得身躯主导权后，巨大哥斯拉选择自爆，但是最后失败被核心埋起来沉睡了…
来到地球和两头哥斯拉对决，最后晶体哥斯拉被打败倒地时，核心控制变弱之际，意识模糊中听到主角哥斯拉的呼唤声，听到小哥斯拉的呼叫声，巨大哥斯拉第一次从沉睡中醒过来！！但是很快就被核心重新压下去了…
现实，人类看着主角哥斯拉好像在做梦一样，问被抓蜥蜴人灌输那些记忆给主角哥斯拉？
被抓蜥蜴人解释，灌输给主角哥斯拉的都是巨大哥斯拉的记忆，是在整理核心蛋记忆时分列出来的，还有很多被晶石控制后的巨兽们记忆，都传送到核心，不过主角哥斯拉需要的是巨大哥斯拉的记忆，还有一些大家看过的记忆，希望主角哥斯拉看过之后知道自己接下来该怎么做…

被抓蜥蜴人解释道，巨大哥斯拉和所有哥斯拉的使命就是守护自己的巢穴，会导致巢穴生死存亡的因素都要排除，所以包括了保护地球。
而巨大哥斯拉在这一个使命上可说是尽忠职守，连低版哥斯拉都懂的使命，可惜主角哥斯拉选择亲情忽视这个使命…
回到主角哥斯拉的梦里，回到高级文明派核心和巨大哥斯拉去其它星球吸收能量的场景，星球枯萎…所有生物死亡…最后巨大哥斯拉炸毁星球！！！然后就是高级文明要派巨大哥斯拉去毁灭地球的一幕，巨大哥斯拉大暴走！！要自爆！！保护地球、保护巢穴、保护主角哥斯拉，消灭高级文明！！突然，核心出现在巨大哥斯拉的眼前！！背景高级文明银河系化为乌有的一刹那！！
核心被背叛之怒、统治宇宙之心、巨大哥斯拉保护之命、地球存亡之遇的画面在主角哥斯拉的梦里没秩序不停浮现…
回到现实，主角哥斯拉已经拒绝蜥蜴人的命令作为选择…是时候让主角哥斯拉知道这一切后自己做选择了…
主角哥斯拉苏醒，治疗完成！！站起来抬头确定方向。
人类疑惑主角哥斯拉的行为，地底蜥蜴人出现解释，主角哥斯拉已经选择了，他要去消灭晶体哥斯拉保护地球，守护…巢穴…
人类讽还有巢穴？蜥蜴人也难堪…
主角哥斯拉的背鳍发光，蜥蜴人带着人类远离躲避。
主角哥斯拉把一道能量注入低版哥斯拉的蛋里，有！还有主角哥斯拉想要守护的，蛋在，这里就是他的巢穴。
但是蛋灌输最后一次能量的时机不是还没有到吗？
蜥蜴人也不懂了，提前灌输可能后果就是蛋会被能量因过多而爆裂…

大家看着主角哥斯拉注入能量完成…蛋发出的蓝白光因为参杂了红色能量变成紫色！！紫色光芒感觉要把蛋挤爆了…
摩斯拉用蚕丝把蛋包起来放回原位，仍然被微微紫光透出…
这样也可以？
蜥蜴人说有待观察，历史第一次…
主角哥斯拉对摩斯拉表示感谢和交托之请，摩斯拉呼声答应了。
人类不解，蜥蜴人感叹…主角哥斯拉把蛋交给摩斯拉保护，摩斯拉答应了…意味着主角哥斯拉已经打算牺牲必要时自爆和晶体哥斯拉同归于尽…
金刚也愿意替主角哥斯拉守护蛋。
主角哥斯拉没有后顾之忧了，他对着确定的方向背鳍发光咆哮发出挑战！！
地表浮空吸收能量的晶体感应到了来自主角哥斯拉咆哮，他接受主角哥斯拉的挑战！！！

接受挑战？单打独斗？
晶体哥斯拉不讲武德的，他控制金刚对主角哥斯拉出手！！
金刚这里说帮忙守护蛋，那里就拿起战斧攻击主角哥斯拉！！
金刚背袭主角哥斯拉，主角哥斯拉发现一个扫尾，金刚躲开，要冲锋之际，摩斯拉空袭吐丝粘住金刚的双脚，金刚动不了！！
摩斯拉飞到金刚身边爬住金刚，用前爪抓住金刚的头，很快金刚昏睡过去…
地上的晶体为主角哥斯拉引路，恭喜主角哥斯拉通过第一关！！

主角哥斯拉头也不回的往正确的方向奔去了。
这次人类和蜥蜴人没有跟着去，蜥蜴人打开地球意志模式，用身上的设备打开实景映射，观看着主角哥斯拉赴约。

主角哥斯拉跟着晶体指示光进入隧道，出来后并不是晶体哥斯拉的所在地，而是一颗正要孵化的晶体蛋的地点。
主角哥斯拉直接把晶体蛋消灭了！！
然后晶体指示光又再引导主角哥斯拉到另一颗正在孵化的晶体蛋地点，晶体哥斯拉似乎是在告诉主角哥斯拉两件事，到处都是正在孵化的晶体哥斯拉，第一地球已经成为晶体哥斯拉巢穴的事实，主角哥斯拉无法消灭晶体哥斯拉，晶体哥斯拉无所不在，第二主角哥斯拉想要一个父亲，到处都是，也是巨大哥斯拉要延续哥斯拉一族命脉的使命，这些问题，晶体哥斯拉都可以一一实现，加入这个大家庭吧！！主角哥斯拉！！
主角哥斯拉怒吼，把晶体蛋消灭！！
晶体哥斯拉给主角哥斯拉机会了，主角哥斯拉不不识抬举，那就别怪晶体哥斯拉。
主角哥斯拉察觉到两头泰坦巨兽靠近，都是被诅咒的巨兽，被控来杀主角哥斯拉的。

主角哥斯拉毫不犹豫把这两头干掉！！对正确的方向咆哮！！
不理会晶体指示光，直接往晶体哥斯拉的方向去了。
越接近晶体哥斯拉的地点，看到越多的联军航母、战斗艇群、战斗机等等残骸…看来这里经过一场大图杀…
天空开始看到战斗晶体浮游着，越靠近越多！！
战斗晶体发现主角哥斯拉和作出攻击，主角哥斯拉焰息护体+爆发+吐息把战斗晶体这些障碍清除，一路杀到底直至看到晶体哥斯拉晶体化浮空，周边还有很多浮空巨大晶体形成的防护罩保护着。
主角哥斯拉一路杀到上岸后，原来有一个地底隧道出入口，很多被诅咒的大大小小泰坦巨兽涌出来！！
这是…主角哥斯拉要以一敌十的前奏！！
一个迎战咆哮！！主角哥斯拉一个冲锋！！
对方一堆泰坦杂兵一群天空和地面战斗晶体应战！！
众人在哥斯拉巢穴看得为主角哥斯拉捏一把汗…
怎么突然冒出这么多泰坦巨兽？
部分是远古被诅咒的，其余的应该是现在被诅咒的…不管地表的还是地底的，大部分不懂水性，所以只能透过传送隧道过来集结，由晶体哥斯拉指引的。
晶体哥斯拉对主角哥斯拉还是有顾虑，所以想消耗主角哥斯拉的能量…
狡猾的晶体哥斯拉！！

被抓蜥蜴人看不下去，担心主角哥斯拉这样会消耗能量至尽…他离开哥斯拉巢穴。
人类问他要去哪里？
他要去地表协助主角哥斯拉。
就被抓蜥蜴人一人？
地底蜥蜴人不为所动。
被抓蜥蜴人告诉人类，地表还有同伴会帮忙的。
说完就离开…
留下地底蜥蜴人保持沉默…

被抓蜥蜴人来到地表，打开信号波，在地球各地以人类形态生活的蜥蜴人收到信号，各自离开自己的岗位（衍生剧一些以人类形态出现过的角色），摇身一变变回蜥蜴人和战甲模式飞走了！！
被抓蜥蜴人也飞走了，大家直接前往晶体哥斯拉的地点，这些蜥蜴人就是在等集结的信号（衍生剧，这些和融入人类世界生活的蜥蜴人都是主动派，愿意接受人类和将知识一步一步间接教授予人类的）。