@小鱼真真 其实就是使用别人的存档，因为P3R存档机制，连同存档分享者的手柄类型也一起复制过来造成的。更惨的是，分享者的给出的解决办法是错的，删掉Saved文件夹，重设键位保存，问题依旧。
我是折腾了很久才解决的，居然是在游戏设置的犄角旮旯里改的：游戏里读取别人的存档（如果是通关存档就继承通关数据开启新周目）—让游戏流程进行到可以操控主角行走—菜单—SYSTEM—CONFIG—游戏系统设置—拉到最下，按钮图标选自动检测①恢复预设②设置完毕③
返回CONFIG—键位设置—键盘或者鼠标按“右”，切换到控制器的设置界面④恢复预设⑤设置完毕⑥，最后返回游戏，保存当前游戏进度即可
艾吉斯DLC因为跟本体不同存档，所以DLC里也要再设置一次
要是还不放心的话也可以在进游戏前的待机主菜单里点CONFIG再设置一次。