说一下我个人认为的伏笔
首先是湖那富有想象力的画就是同学们变的怪物，不过不清楚原因。其中有一些还没登场，推测可能有病死的园长，紫砂的蘑菇头，强健犯囚禁的怪物（会不会就是隐身那个），还有一些其他角色。

其次是家族祭祀的怪物，应该是孩子们的基因母体，形态似乎和时雄发动能力后的样子有点类似，不知道有没有关系。

然后是学园的超级计算机，远远超出了时代的限制，而且是人形，还有过似乎是包庇时雄的行为。推测可能也和学院的学生有关系（大胆脑洞一下，莫非是时雄的孩子？）。

最后是强健犯，女主隐约靠身体记忆感受到姐姐的记忆那段，似乎说明他和姐姐早就有一腿，应该和姐姐中枪有关联。

对了，还有一点，关于蘑菇头和美美姬，他们的感情线应该开始于美美姬的照片，但是那张照片来源不明，推测和超级电脑有关。这样看那台超级电脑很是神秘啊。
另外，最开始紫砂的学生跟异形似的“战士”很像，可能他就是“战士”们的母体。湖那说导致他死亡的人会夺走时雄，这点似乎也还没体现。

说起美美姬，还有个比较有意思的点。她被墨镜女孩看到的时候幻觉是被打针和切割，这和她日后的悲惨经历十分相似。结合她的预知能力，莫非她潜意识预知到了以后自己的结局并且感到恐惧？