山海界中，东皇钟转世为夏柔。天女之灵无法继续维系封印，天女封印力量衰退，山海界天气异变。因资源匮乏，山海界进入战争状态。陆承轩力量爆发，轼亲。皇甫慕云为解救天女，以盘古斧之力进入山海界，陆承轩也被一同带入。轩辕剑伍故事开始，皇甫慕云救出天女之魄，积极收集不灭之火意图以朱雀灵兽解救破除青龙灵兽的封印。陆承轩与夏柔相识，同去遗世之都接受继任青龙圣者的测试。夏柔被选中为第三任青龙圣者，寻找失散的二十八颗星曜石。天女之魄青魅占据青龙圣者身体，完成魄灵合体。
分支1：星曜石收集齐全。朱雀灵兽复活，天女完全苏醒。因皇甫慕云的牺牲，天女自愿被再度封印。
分支2：星曜石收集不齐全，一场恶战后青魅被消灭，而皇甫慕云和陆承轩同归于尽，恢复为神器原形（按《天之痕》古月说法推测，普通结局为真结局）。轩辕剑伍故事结束。此为我们所存在的历史。
在（青龙圣者所说的）人间界几百寒暑后（估计就100+年），青龙圣者（夏柔）持轩辕剑（真）（约在公元363年前）踏碧波从夷洲方向回归人间界，耶亚希由于剑气的护佑灵魂不灭终与曾得到横艾秘授机密的皇甫朝云以灵魂状态相聚，其后轩辕剑为水镜所得！
公元363年，桓远之出生（注：此历史不存在，原因见公元383年分支2）。
公元366年，慕容诗出生。
公元373年，太一神殿大门千年一次再度打开的日子，慕容诗再见桓远之的日子（此时间按照计算得来，感觉有些剧情BUG）。这个估计还要后点发生，因为会造成历史上同时出现两把轩辕剑，所以估计在桃园后面发生，轩辕剑也回归人间界
公元383年，淝水之战。
分支1：秦国大败晋国，桓远之巧入云中界，遭遇疾鹏，得知了五岳阵和失却之阵，遂利用天书和尚在神器殿的上古神器部下失却之阵回到了春秋时代，意图改变历史。但是此段历史因为桓远之的关系，使得存在率完全消失，所以也就不存在，也不是我们所经历的历史。
分支2：由于桓远之成功的利用五岳阵成功的影响了生克。晋国大败秦国，慕容诗在水镜（留侯夫人）的帮助下，带着这个时代的轩辕剑（剑是慕容垂给予，因此推测，轩辕剑应该在之前就从水镜手中脱出，也许是因为水镜看到轩辕剑，才愿意帮助慕容诗），利用桓远之在云中界造成的时光裂痕，回到了春秋时代，也意图改变历史。由于成功添加上“秦克晋”的生克，加速了历史进程，所以此段历史亦不存在（造成七曜使者的原因）。
（这个符合历史发展）分支3：由于桓远之成功在太一轮上添加了“晋克秦”的生克。晋国大败秦国，慕容诗在水镜的帮助下，带着这个时代的轩辕剑（逻辑不完善的地方，按道理轩辕剑应该在山海界吧？！还是说那几百寒暑只有100+年？！）利用桓远之在云中界造成的时光裂痕，回到了春秋时代，也意图改变历史。但是没能成功，与前世车芸记忆融合，回到属于她的时代。（题外话：桃花源记故事发生的时代也就在于此）