在取得胜利后，第三代教宗变得更加自负和不思进取，开始不理朝政，也放松了对各个派系的控制。于是从二一六年开始，十字军帝国迎来了长达五十八年的“黑暗时代”。

在铁甲纪二五一年的时候，一批法兰尼西亚的武士被选进了僧侣骑士团，其中一名成员在随后的一次突袭中觉醒为杰拉德

铁甲纪二五七年，大汉进攻罗马帝国，十字军则选择帮助罗马帝国，并进攻汉帝国的新西凉，企图“围汉救罗”，最终在云梦泽大战中被黄忠和周亚夫击败

随军的杰拉德只能经蜀川逃跑回国，沿路屠杀百姓，被称为“西夷鬼”。逃出生天的杰拉德被当成是战败的替罪羊，险些执行火刑，多亏僧侣骑士团的大团长希伯兰德救下，才通过一劫，但自此之后杰拉德一直活在“逃兵”的骂名下。

为了堵住别人对自己“逃兵”的骂名，杰拉德只能谋取更大的权势，于是他收集了曾经救命恩人希伯兰德不守教义的证据交给了鲍德温家族，于是僧侣骑士团大团长希伯兰德被处以火刑，而杰拉德则在鲍德温家族的支持下成为了新一任的僧侣骑士团大团长。

在这之后杰拉德利用职务之便大肆打压异己和收敛钱财，而后杰拉德又找机会背叛了鲍德温家族，倒向了第三代教宗。

值得一提的是，铁甲纪二六六年当僧侣骑士团大团长还是希伯兰德的时候，就曾因喜爱一位团员生下的子嗣并给他取自己的同名，也就是小希伯兰德，他也被其他团员称为“小团长”，但在杰拉德上任后，便对其“小团长”的称呼感到不悦，后来甚至派小希伯兰德的生父去送死，双方也因此结仇。而小希伯兰德在之后则与一位来自鲍德温家族旁支的剑士艾德萨结为了义兄弟。

铁甲纪二六七年，十字军帝国的世俗王由鲍德温家族的阿马里克一世担任，随后在二七四年的时候，阿马里克的老婆生下了一男一女，分别是日后的鲍德温四世和伊莎贝拉。

同样在二七四年的时候，圣国大主教尤里乌斯二世联合法兰尼西亚、布列格兰、阿米尼乌斯大公国的力量，包围了十字军帝国第三代教宗的所在的奥耶利哥，最终攻破了教宗城并处决了第三代教宗，享年一百五十九岁，结束了从铁甲纪二一六年开始长达五十八年的黑暗时代。
（注：在中世纪中晚期的教阶里 教宗是最高一级 各大教区的大主教则是次一级 下面还有主教等等 ）

原来的大主教尤里乌斯二世则成为了十字军帝国第四代教宗，进行了一系列的政教改革，开始放宽并接受异教，这使部分神教狂热分子难以接受，于是他们便另外建立了新的教派（只是教派 不是宗教 也就是异端而非异教徒 差不多等于是对神教信仰的不同解读 就像历史中天主教 东正教的关系一样），这也就是旧教派的雏形。

而杰拉德也顺应时势投靠了第四代教宗。但第四代教宗并不喜欢杰拉德，反而更喜欢杰拉德的副官，并引导副官进行了觉醒，希望得到这位副官的感激和效力，最终这位副官觉醒为了腓力二世。

但第四代教宗错了，因为腓力二世不论历史上的前世还是觉醒前的今生都来自卡佩王朝，而卡佩家族正是铁甲大陆中法兰尼西亚的统治者，这无疑是对地方实力的一次增强，于是便起了杀心。

腓力二世则立即向教宗宣誓，并表示没有教宗同意绝不返回法兰尼西亚，这才打消了教宗的疑虑，并命腓力二世跟随杰拉德驻守圣城。

铁甲纪二八零年，麻风王鲍德温四世觉醒，被第四代教宗收为养子，第四代教宗希望将鲍德温四世培养为最适合与自己配合的世俗王，巩固与鲍德温家族的关系，这便是“养子计划”。