除了寒武纪物种大爆发外，还有奥陶纪海洋物种大爆发、白垩纪开花植物的物种大爆发等，连八十多万种有翅膀的昆虫也是突然大爆发式出现的。物种大爆发问题目前是进化论界的世界级难题。
进化论学界有一种“间断平衡论”，又称为“骤变说”，认为生物的变异，是“非偶然的，非渐进”的，其至只需要一个步骤便能从一个物种变成新物种了（这是《西游记》？），通俗点说就是猿猴在某个时间点，会突然变成人了。这种理论证明了进化论学界也是承认物种大爆发的事实的，要不然就不必弄出这个理论了。
但达尔文说如果生物的进化不是基于微小连续的变化，他将视这种进化论为粪土，因为这意味着有超自然因素的介入。
确实，间断平衡论太像神创论（或智能设计论）了。
很多进化论者因解释不了寒武纪物种大爆发，便使用寒武纪之前的埃迪卡拉化石群来说事。殊不知，埃迪卡拉化石群仍然是一个小型的物种大爆发，它本身就是一个令进化论无法解释的生物复杂性飞跃的证据，虽然这个飞跃还不足以巨大（或是类型正确）到导致寒武纪大爆发的发生，但如埃迪卡拉化石群的金伯拉虫、狄更逊水母和海绵这类生物体已经是有着非常复杂结构的生物体了，而之前的化石的记录只有单细胞有机体和繁殖藻类。要想从单细胞有机体中产生海绵、蠕虫和软体动物，有点像让一个旋转陀螺转化成一辆自行车。虽然自行车远没有汽车那样复杂，但它的工艺复杂性相对于旋转陀螺来说已经是一个悬殊极大的飞跃。因此，埃迪卡拉生物群也证明了短时间内的生物复杂性的飞跃在通过自然选择作用的随机突变机制下是无法办到的。
根据最新的放射性测量研究计算，寒武纪持续时间约为1000万年，从地质学来看，这段时间是非常短暂的，因此古生物学将之称为“爆发”。物种大爆发的事实，是举世公认的，包括进化论者。
另外，越来越多的恐龙化石的软组织（如血管等）被发现，这不是说软组织化石，而直接就是有机体的软组织，更证明了进化论的时间估算是有问题的，目前，进化论把演化建立在广长时间的假设已经越来越受到质疑了。