邪鬼，首次登场于第5集。百科里写得大概还算详细，他会控制岩石攻击，且被雨水浇灌后能复活，靠多次复活挨过了金目教篇。而他愣是靠好色这点在结尾洗白了，他的洗白可能比霞丸的洗白更突兀。

巨鹰，第13集登场。
赤影通过巨鹰的爪子跳到了背上。虽然巨鹰很大，可是巨鹰的主人很菜，巨鹰的主人用鞭子捆住赤影的左臂后，赤影用刀砍断了鞭子，然后巨鹰的主人摔死了，而赤影被“驾驶”风筝的白影救了。巨鹰飞走后没了下文。

第2关的关底boss，无法确定是第8集冒充赤影的傀儡甚内还是第11集偷南蛮大炮设计图的阿修罗兄弟。傀儡甚内的真面目也就在第8集结尾有类似骷髅头的面部特写。

金目教篇里，用那种大砍刀的boss不好找，而刀枪不入的应该是第12集的钢铁忍者若铁，他在这集负责寻找足利将军的后代松千代。赤影将锁分铜捆住他的一只脚后将另一头捆在石头上，然后用刀砍破石头使得他摔到瀑布的下游。由于他任务失败，幻妖斋用金目像砸死了他。

蛤蟆法师，第2集登场，会召唤大蛤蟆，原型可能是自来也，而这模样倒让我想到了动画片《龙娃》里的银蟾。他和山吹的爸爸一起对付青影和赤影，在作战失败后不知什么原因杀了山吹的爸爸，并嫁祸给赤影，激起了山吹对赤影的仇恨。不过霞丸从蛤蟆法师的叙述中发现了不对劲，后来杀死了蛤蟆法师，算是为山吹报仇了，不过霞丸不敢向山吹说实情。

大蛤蟆，蛤蟆法师的“通灵兽”，与蛤蟆法师一起登场在第2集。赤影在本集确实用炸弹炸了大蛤蟆的嘴，不过大蛤蟆不是被炸成渣，而是逃进了水里。

胖和尚，首次登场于第4集。游戏里他是像影子传说的妖僧那样喷火，而动画里他喝酒后喷的是烟雾。第7集他曾搞出大蜘蛛幻象，结果被赤影识破，后来被赤影、山吹一行人打败了。

金目教教主，登场于第1集。由于茜和正太的爷爷不信金目教，金目教教主用火球烧了她家和她爷爷。赤影识破金目教教主的作案手法后用同样的手法为大家揭开真相，金目教教主被赤影捆住后自爆了。不过金目教并未因为他的自爆而消失，因为该邪教的幕后黑手是最终boss。
游戏中该boss所在的山，在动画中叫鬼面山。

巨蛇，大蛇丸养的，登场于第9集和第10集。大蛇丸自称是影一族的，从而离间了信长和赤影一行人。后来富藏把强力炸弹发射进了巨蛇的嘴里，炸死了巨蛇。

金目像，第1集就有，第12集曾砸死若铁。第13集和第14集，该雕塑的眼睛发射的光线能将金目教的教徒们搞得像丧尸一样，第14集该雕塑甚至站起来了。幻妖斋操纵的该雕塑给我感觉像古代武斗机。后来赤影吸引幻妖斋的注意，青影炸了上方的岩石将金目像砸了。不过幻妖斋并没死，他用手铳打死山吹后，念动咒语将自己的神殿搬走了，从而拉开了幻魔城篇的序幕。

岩龙，第22集登场，感觉像是生化危机4里的湖怪有岩石一样坚硬的皮肤，和巨鹰、巨蛇一样有主人。后来，赤影用刀捅瞎了它的双眼，它愣是把主人和部分敌方忍者吃了，然后和巨鹰一样撤走后没有下文。

幻魔城篇拿叉子的应该是幻魔三人众之一夜叉王，首次登场于第17集。第15集~第20集的主要剧情是幻魔三人众带着手下寻找平贺一族的宝藏。夜叉王的武器包括刀、叉（别当成吃西餐）和用铁链连接的转盘，他在第17集还用过将刀插在对方影子上使对方无法行动的影塗之术。第20集，他带着手下在龙神瀑布的山洞内部寻找宝藏，在与赤影、茧姬一行人战斗时用转盘切坏一些石柱导致山洞内部崩塌，后来赤影砍断了转盘的铁链，导致夜叉王被自己的转盘杀死，与平贺一族的宝藏一起被埋了。他的结局倒让我想到了电视剧《水浒后传》里宋江的儿子宋士骏。

暗天竺，幻魔三人众之一，只在第16集和第17集登场。他在第16集会控制骷髅兵（可能通过木偶线控制），在第17集会催眠术，他的催眠术给我感觉像是西洋催眠术的钟摆换成了日本土偶，而且该催眠术能通过被催眠者的眼睛“传染”出去。后来，赤影在进入暗天竺的催眠幻象后扔出了苦无，该苦无穿透了幻象直接命中了暗天竺的额头。
游戏里，暗天竺的下一个场景可能还原了动画中的催眠幻象，可是两者都只会发射泡泡。

更正一下。根据FC图库提供的说明书，4楼应该改成10楼的鼯鼠小六，10楼应该改成11楼巨蛇的主人大蛇丸，而15楼不确定，因为说明书里有幻魔龙，我完全没印象。