没有明确说明，被留白了。不止这些，第三部没有明确说明的东西太多了，给我的感觉像是不知道怎么去解释但偏要往那个方向去推动剧情而干脆不解释了。

1我也想不通，小宇宙是没有时间概念的，只要进去 下一秒程心说不定就出现了，只有一个合理的解释，小宇宙当时还没发明出来 或者放置小宇宙需要很久的时间，然后这过程中云跟艾AA相爱了，为了防止尴尬所以就不进去了。
第2点小说里好像说了，三体人怕地球人报复，所以不告诉人类这个安全声明，因为有了光速飞船，就有可能找到他们，然后复仇

可能性有很多，没有一定要怎么做或者一定不要怎么做。
只要有可能性，小说把这一种可能性写出来了，就是合理的。
就像你吃米饭面条都可以，你今天中午吃了米饭，别人问，为什么不吃面条，就很没意义。
分析一下合理性：
1、云天明和AA具体过着怎样的生活并没有明写。
有没有可能，云天明移情别恋喜欢上AA了，在一起了？
有没有可能，进入不同的时间流速本就意味着天人永隔？
比如云天明进小宇宙，结果程心没找到小宇宙入口，而云天明又把时间流速调大了，结果他睡了个午觉程心已经在外面度过了一生？
有没有可能，刻在石头上是程心和AA的默契，AA看到云天明，重色轻友，没说这个事情，抢了云天明，等快死了才跟云天明灵机一动说刻石头？以云天明的感情纯度，随便来个茶艺高手轻松拿捏。云天明感情上差不多也就胖猫层次吧？
2、三体不告诉人类很不合理么？他为什么一定要告诉人类？