1949年12月,因长江洪水泛滥,国立安徽大学从安庆迁往芜湖,与省立安徽学院合并组建成解放后安徽省唯一的学科门类齐全的综合性大学——新安徽大学。讨论1950年至1953年,全国高等学校院系调整,安徽大学历经了三次院系调整,调整后的安徽大学仅由两个学院组成:师范学院和农学院。
1954年2月,中央决定:“撤销安徽大学校名和建制,其所属师范学院、农学院分别独立为安徽师范学院、安徽农学院”。同年4月,安徽省政府决定安徽农学院迁往合肥办学。安徽师范学院和安徽农学院经过多年发展,成为现在的安徽师范大学(芜湖)和安徽农业大学(合肥)。