先来说说综合实力最强的玄冥教：
冥帝·朱友珪：死亡
鬼王·朱友文：死亡
残尸败蜕·尸祖降臣：存活
冥海无岸·尸祖萤勾：存活
血染河山·尸祖侯卿：存活
赤地千里·尸祖焊魃：存活
孟婆：失踪
钟馗·钟小葵：失踪
水判官·杨淼：死亡
火判官·杨焱：死亡
仁圣阎君·蒋仁杰：死亡
崇圣阎君·蒋崇德：死亡
玄圣阎君·蒋玄礼：死亡
元圣阎君·蒋元信：死亡
昭圣阎君·蒋昭义：死亡
黑无常·常昊灵：失踪
白无常·常宣灵：失踪
其次是通文馆：
晋王·李克用：死亡
圣主·李嗣源：死亡
世子·李存勖：死亡
亚圣·李嗣昭：死亡
仁字门门主·李存仁：未登场
义字门门主·李存义：存活
礼字门门主·李存礼：存活
智字门门主·李存智：未登场
信字门门主·李存信：未登场
忠字门门主·李存忠：死亡
孝字门门主·李存孝：死亡
惠字门门主·李存惠：死亡
勇字门门主·李存勇：死亡
忍字门门主·李存忍：失踪
沙陀族三大高手巴尔、巴戈、巴也：死亡
殇组织：队长失踪，其余四人皆死亡
最后是综合实力最弱的幻音坊：
女帝：情况不明
岐王·李茂贞：死亡
姬如雪：存活
梵音天：死亡
妙成天：情况不明
玄净天：情况不明
广目天：情况不明
阳炎天：情况不明
多闻天：情况不明
娑罗天：未登场
炎摩天：未登场
自在天：未登场
目前来看能得出以下结论：
三大组织里只有玄冥教的成员已经全部登场；
截至第六季结尾，三大组织里只有玄冥教已经开始分崩离析；
三大组织的最强战力（晋王、岐王、鬼王）皆已死亡；
玄冥教和通文馆所效忠的国家皆已实质上的灭亡；
玄冥教和通文馆都有不良人的卧底，幻音坊的情况尚不明确；
即使除去已经阵亡的成员，玄冥教的实力仍然为三大暗杀组织中最强的一个；
由于通文馆和幻音坊都还有三个成员未登场，无法判断现在通文馆和幻音坊谁更弱；
通文馆和幻音坊未登场的成员预计皆有可能在第八季登场；
截止到第六季结尾，幻音坊的战损仅有岐王和梵音天，玄冥教和通文馆的战损都比幻音坊要大得多，但是以目前第七季的剧情来看，幻音坊已遭遇重大变故，可能会出现比前两者更为严重的战损。