《尚书》之由来
唐孔颖达所撰《尚书正义》谓：“尚者，上也。言此为上代以来之书，故曰尚书。”故尚书即上古之书也。东汉郑玄注曰：“孔子撰书，遵而命之曰：尚书，尚者上也，盖言若天书然。”其意上古圣道王化之书，应尊尚视为至高至上之书。两者意义相近，简要言之，为值得尊崇之上古之书也。但亦由此可知，乃后世之人加冠，称之为“尚”；则其本称，应为“书”或“书经”。
一般通说右史记言，左史记事。记事则为春秋，记言则为书经。故而三国魏人王肃据此而言：“上所言，下为史所书，故曰尚书。”亦由此可知，乃唐、虞、夏、商、周五代史官所记政事之言论纪录档案而已。故尚书实际是合唐书、虞书、夏书、商书、周书，经孔子删节整理而成。遂与诗、礼、乐、易、春秋并列为孔门六经教材之一。自乐经佚亡，乃为后世五经之一。
今文尚书与古文尚书
据说《尚书》经孔子删整原有百篇，秦火之后，尚书失传。当时山东济南有一位伏生，于战乱之中，只保存了二十九篇（一说二十八篇，另一篇为河内某地女子所发现）。于是汉初他就以这《尚书》的残篇二十九篇，于齐鲁一带设塾传授学生，渐渐闻名天下。到了汉文帝时，伏生已经九十多岁，行动困难，不便奉诏到长安讲学，文帝派鼂错去从他学习，由鼂错用当时通行之隶书，抄录下来，流传全国，是为“今文尚书”。
伏生去世，其门人弟子中也有各自传授，见仁见智互有出入者；致每家各有不同之见解诠释，称之为“家法”或“师法”。当时较为著名的有三家，即欧阳和伯及大小夏侯（夏侯胜与夏侯建。）汉宣帝并为此分家各设博士，据史载各家竟有十四博士之多。到了东汉，今文尚书由马融、郑玄加注，于是更广为流传。
迨后汉鲁恭王拓建孔庙，于夹壁中发现保存之古籀文所书之经书多卷，如《论语》、《诗经》、《易经》、《春秋左传》、《孝经》等。其中也有书经四十五篇，比今文尚书多出了十六篇，由此也足证伏生所传二十九篇，内容大致真实无伪。这些经书由鲁恭王送还孔子后裔孔安国，再由孔安国呈献汉景帝，此即为“古文尚书”。但当时却没有人完全通晓籀文，直到哀帝时，刘向刘歆父子用今文尚书比较校勘，发现两者之间不无疏误脱漏之处，且一一订正，是为古文尚书。力主当以古文尚书为准，另立博士。于是有今文尚书、古文尚书之争。虽然朝廷并未采纳，然而其时民间私学，已以古文尚书为然，蔚为风气。
伪经尚书（伪古文尚书）
在五经之中最多周折与灾难者，乃是《尚书》。今文尚书残缺不全，百篇只剩了二十九篇，内容文字且多疏误脱漏。而古文尚书被人发现，却无人通晓，及至刘向父子校勘，但又不为朝廷所重，未能妥加善视与安全保存，以致后来再复流失湮没而失传。其后竟有人分割掺杂今文尚书，来改写假冒古文尚书，弄得真伪莫辨，面目全非。先是东莱人张霸将伏生的今文尚书分割成了七十多篇，凑上自己伪造的二十四篇，再加左传、书序，凑成一百零二篇。献于汉成帝，几乎被蒙骗过去。但因文辞粗陋，先后不一，终经刘向识破，张霸乃下狱。
三国后，两汉之存书又复全毁于战火，生民流离，遍地烽火，《尚书》又复失传。魏人王肃（晋武帝外祖）曾先后伪造了“孔子家语”，也伪造了“古文尚书”，他将搜到之今文尚书分割为三十三篇，另加自己所撰伪造之二十五篇，共凑为五十八篇。以求符合汉书中班固所记篇数，假冒为古文尚书。是时司马氏已篡魏自立为晋，权势盖天，无人敢指摘王肃之伪经不是。其后再经战乱，伪经也失而复得，由晋时之梅颐（一作梅赜）发现于民间，遂因之流传后世。唐孔颖达即依据王肃之这一部伪经，而撰《尚书正义》。唐高宗后更鉴定颁行天下，且以为考举选士之依据。于是伪经尚书千年来取而替之，真正的尚书，反倒湮灭无闻了。这也是中华文化史上的一段奇案。宋朱晦庵（朱熹）先生曾对伪经尚书文笔之流畅、明朗，和三代（即夏商周）文学的古朴、艰涩，迥不相同，有所怀疑。直到明清考据兴起，先后经学人阎若璩、惠栋、丁宴从考据中将伪经推翻，删除王肃伪造部分，恢复被分割支离部分，并从而致力搜集民间残存之今文尚书，与马、郑两注。在尚书历劫千年之后，虽是断简残篇，总算起死回生，保存了部分面目。但孔庙发现完整之古文尚书，则早已不再存在矣。