脑循环功能障碍治疗仪与经颅磁电疗仪有以下区别：
原理不同
- 脑循环功能障碍治疗仪：主要通过重复性的经颅磁刺激（rTMS），产生感应电流刺激大脑神经细胞，调节大脑神经递质的分泌和神经元的活动；同时部分仪器还结合了仿真生物电刺激小脑顶核，改善脑部血液循环。
- 经颅磁电疗仪：一般是将脉冲磁场和交变电场相结合，磁场作用于头部，可在大脑皮层产生感应电流，电场也能直接作用于脑组织，二者协同调节大脑神经功能。
功能侧重不同
- 脑循环功能障碍治疗仪：侧重于改善脑循环，如增加脑部供血、促进侧支循环建立等，常用于治疗缺血性脑血管病、脑动脉硬化、脑供血不足等，也可用于改善失眠、认知功能障碍等症状。
- 经颅磁电疗仪：更强调对神经功能的调节，除了可用于治疗脑血管病后遗症、失眠、焦虑等，还对一些精神心理疾病如抑郁症、强迫症等有一定的辅助治疗作用，在调节情绪、改善认知方面有一定优势。
治疗模式和参数不同
- 脑循环功能障碍治疗仪：通常有多种刺激频率和强度可供选择，以适应不同病情和患者个体差异，一般刺激频率在0.5-100Hz之间，刺激强度可根据患者耐受程度调节。
- 经颅磁电疗仪：其磁场强度和电场强度的调节范围与脑循环功能障碍治疗仪有所不同，磁场强度一般在1-20mT，电场强度在0-5V/cm，且其脉冲波形和频率组合也有自身特点，以实现不同的治疗效果。
以上区别仅供参考，具体产品可能因生产厂家不同而存在差异。