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几何优化后结构变了
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猫巷酒馆
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各位大佬,我构建的氧化锌纳米团簇施加了compassiii力场后,进行几何优化之后结构发生了明显变化(键长,键角变化很大),这个怎么解决?
送TA礼物
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1楼
2025-03-18 15:36
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巨镰神教
人气楷模
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图呢
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2楼
2025-03-18 17:20
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活宝大玄
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还是力场和电荷设置不合适导致的,另外也可能和精度里的预设力和能量有关系。如果是前者可以适当换一些相近的力场先跑一跑试试,而且要手动分配各种原子甚至各个原子的力场,不要让系统自动分配(但最好还是参考文献,因为相近力场不一定正确),然后就是电荷、可以找找forcite模块相应的电荷基组选取教程,网上有。如果是后者,可以自己适当降低一下预设力或能量,实在不行先关掉跑跑试一试。
如果以上方法都不能解决你的问题,那可能是你的模型构建有问题,需要严格参考该物质的化学构型、或参考文献中的构建方法。
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3楼
2025-03-18 20:58
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活宝大玄
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我看过比较古早的一篇文献,里面对Universal力场的评价还行,精度不算太高但计算一个大差不差的结果倒是没啥问题。而其他小众力场经常缺失某些元素的力场,对于复杂体系不友好。我建议是,如果COMPASS力场反复调试仍然出现化学键异常拉伸和别的问题,那就看看电荷设置,如果还不行就只能换力场了,不能因为COMPASS力场精度更高而让整个体系都不合理。
IP属地:甘肃
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4楼
2025-03-18 22:06
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活宝大玄
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3
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当然,你也可以试着调整一下模型,或许也跟这个有关系
IP属地:甘肃
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5楼
2025-03-18 22:06
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