兽族在三叠纪落败于龙族一部分归因于在呼吸系统这方面上有几大缺陷:
1.死腔,不仅其中的废气与新鲜空气融合会减小扩散梯度减小肺从空气中提取的氧气量。合弓纲早期细分支气管道无脑堆表面积还放大了死腔大小。在现代哺乳动物肺中,肺泡表面的驱动压力由于新鲜空气与陈旧空气混合,从 21 kPa 降低到约 13 kPa,损失了约三分之一的初始头部压力。
2.扩散距离不同导致通气不均匀性。哺乳动物肺的气道和血管系统形成复杂的多代二分分支树状排列,Briggs 1992年 观察到肺血管系统的有效分形维数为 3,仅动脉的有效分形维数为 2.7,在人等哺乳动物中动脉和静脉树的直径元件的分形维数分别为 2.71 和 2.64。高分形尺寸可最大限度地增加呼吸表面积,并允许以低能源成本进行灌注。然而高分形结构也有缺点,它带来了不同的扩散距离。肺的上部的支气管及其子分支由于离初级级支气管较近气体扩散距离更短通常气体的灌注要比下方的的支气管的气体灌注更优良。这导致实际只有肺的上部主要参与气体交换。这会让肺下端的呼吸部的大量呼吸表面积被浪费。而主龙类的三级支气管是平行的,扩散距离差不多,因此基本不存在这种情况。

(上图为哺乳动物的均匀池交换)
3.低效的均匀池交换。合弓纲肺泡气体交换的这种方式叫做均匀池交换,这种交换方式依赖于扩散机制,而扩散的基本原理是从高浓度到低浓度。理论上最高可以达到50%的氧提取率,因为新鲜空气和缺氧血停止氧扩散的时候意味着空气和血液氧分压相同二者氧分压曲线碰到一起达到饱和点即血液和毛细血管的血液氧浓度相同,血液从空气中最高能提取出了一半的氧气。然而理论最高上限也只是理论最高上限罢了。现代大部分哺乳动物实际氧提取率测定值只有20%左右,说明离开肺部的废气的氧分压连氧饱和点都没碰到。为什么实际只有20%的氧提取率是因为均匀池交换依赖于气体扩散机制,理论上只要憋气足够久就可以达到50%的氧提取率。但动物只有潜水时会一直憋气,因此让陆生合弓纲动物达到50%的氧提取率基本不可能。
而蜥形纲主龙类的交叉流多毛细血管连续动脉化系统的气体交换方式则不同,通过对多个灌注了相同氧分压缺氧血毛细血管与三级支气管的交叉布局,血液与空气顺序氧合,其中在空气毛细血管和毛细血管之间交换的无限少量 O2被汇集 .从肺返回心脏的含氧血液中 O2的量来自一种加性效应,最终离开肺的含氧血液氧分压会高出肺呼出的废气,多毛细血管连续动脉化系统通过延长脱氧血液暴露于吸入空气的时间和距离,在很大程度上提高了气体交换效率。,并且突破了扩散限制。在一些鸟类中,氧提取率为60——70%

(下图为鸟类或其他主龙类的的交叉流-多毛细血管连续动脉化系统交换)