当菲拉偷偷帮扎克斯躲开了那颗致命的子弹,也就宣告了这个世界的毁灭。
扎克斯没有死,而克劳德持续昏迷,雪崩小分队在缺少了克劳德帮助的情况下独自面对神罗被团灭,13和爱丽丝逃亡失败,扎克斯虽然救下了爱丽丝,然而克劳德与爱丽丝却始终昏迷不醒,那个世界里,无论扎克斯如何选择,整个世界最后的命运都将走向灭亡,萨菲罗斯也即将找上门,夺走还留在那个世界的白魔晶石。身为古代种的后人爱丽丝,在古代种神殿发现了这一点后,通过古代种独有的力量,穿越生命之流,来到了那个必将灭亡的世界,叫醒了昏迷中的克劳德,把还留在那个世界的白色魔晶石交到了克劳德的手里,并通过古代种的力量将克劳德送回了那个扎克斯已经死亡的世界。临行前的约会,代表了爱丽丝的不舍、阐述了爱丽丝的苦涩,也告知了这个选择错误,这个世界,其实大家已经都死了。当萨菲罗斯找上门的那一刻,爱丽丝也将携带着白色魔晶石的克劳德推入了那条能够穿梭于生命之流的光之隧道,到达了一个没有被萨菲罗斯发现的世界,在那里,克劳德亲手把白色魔晶石交到了爱丽丝的手里,因为只有爱丽丝、一个活着的爱丽丝才能发动白魔晶石。
回到现实吧,不要轻言改变,自由也是很可怕的。想要挣脱命运的束缚,就要像克劳德一行人一样,在高速公路尽头穿越那道命运之墙,历尽磨难,通往未来,命运之墙崩塌的那一刻,世界迎来新生。那些能够影响生命之流、能够影响菲拉的人们,不要妄想轻易改变,这样只会带来更大的灾难。
爱丽丝也不想死,她也随着大家一起,穿越了那道命运之墙,然而菲拉、或者说已经收到萨菲罗斯污染的菲拉,不允许白色魔晶石里面那股神秘力量一起通过,留在了它原来的主人那里,也就是那个没能穿越命运之墙的爱丽丝那里,随着这个旧世界一同毁灭。
常年浸泡在生命之流当中的萨菲罗斯,显然已经知道了白魔晶石的存在,也知道了白魔晶石存在的意义,想要达成萨菲罗斯的目的,就一定要亲手毁掉这颗白魔晶石,或是毁掉这个能够发动它的人。所以在忘却之都,爱丽丝选择了一种看似自杀的方式,独自走向祭坛,没错,她就是想让萨菲罗斯亲手杀死她,让萨菲罗斯不再顾忌,在他彻底放飞自我,使用出自己的全部力量、准备给这个星球最后一击的时候,再出来阻止他,消灭掉他的妄想,剩下的,就交给爱丽丝的这些好伙伴们吧。
爱丽丝死了,萨菲罗斯以为他得逞了,他穿梭于现实世界与生命之流中,妄图实现整个星球的再结合,然后一举毁掉它,只是他不知道,克劳德没有把白魔晶交给这个现实世界中的爱丽丝,而是将它留在了另一条生命之流的世界中。
黄花就是路标,克劳德遵循着那个比他更成熟一点的女孩给他指引的方向,紧握路标;同样,坠入萨菲罗斯制造的生命之流裂缝当中扎克斯,也顺着这个路标,来到了“虚空”当中,尽管二人奋战,然而对于还活在现实世界当中的人来说,人死了就是死了,不论如何挣扎最终依然要分开,扎克斯独自面对着那个旧世界的萨菲罗斯,抵挡着他的进攻,蒂法他们则在那个新生世界中奋力抗争,而克劳德带着萨菲罗斯野心的最后一块拼图——那个能令萨菲罗斯再次复活的黑魔晶石,徘徊在虚空之中,萨菲罗斯找到克劳德,二人宿命的对决即将上演,可令萨菲罗斯没想到的是,在另一个世界,一个不被萨菲罗斯所察觉的世界,爱丽丝带着她的白魔晶石再次出现!还没能完全恢复的萨菲罗斯再次被拥有神圣力量的爱丽丝击退,而克劳德则带着爱丽丝的希望,回到了那个属于他的新生世界当中。