不影响，而实际上无论你通不通知铁路和兄弟会都会来
结局取决于你怎么对待合成人，如果你没回收合成人（无论是杀了还是放了），好大儿会质问你发生啥事为啥任务没完成，你跟他服软坦白是自己把事情办砸了、或者撒谎骗他就不会和学院敌对，学院线暂时可以继续，但你如果跟好大儿硬刚他就会当场把你驱逐出学院，学院线中断。如果你按照学院要求回收了合成人，好大儿会夸你一顿，铁路和兄弟会会比较沮丧，但都不会因此跟你敌对。
有名字的npc也是会死的，前提是你亲自开枪打死。

有时带名字的npc会因为莫名其妙的原因死亡，我现在玩的这个档史塔顿就死了，铁路第一个任务黑夜的波士顿，他会到教堂发信号然后任务由高屋接手。我后面做黑魔鬼任务时发现他死在教堂附近了上个生存档还有更离谱的，迪耿当我随从时我在回刽子手小巷的路上迪耿莫名其妙被击倒地，下一秒死亡我被铁路敌视

最近重玩了下，这个任务最容易死的带名字NPC就是长者史塔克，但大多数玩家的史塔克在黑夜里的波士顿任务里就会死，打了非官方修复似乎会给你重新刷一个活着的史塔克（我最近的档里史塔克死在教堂附近尸体都生苍蝇了，但等我做邦克山战役的时候又眼睁睁看到一个史塔克刷到了我眼前）

话说为什么我做完邦克山之战以后也和学院翻脸了，所有的NPC还都保持着战斗时候的畏畏缩缩的样子。什么时候才会恢复啊