灵梦和魔理沙是好友，魔理沙和咲夜互相偷窃，灵梦和八云紫之间因结界的关系有联系，魔理沙和爱丽丝在永夜异变后成为朋友，蕾米和咲夜是主仆关系，妖梦是幽幽子的仆从和剑术老师，八云蓝是八云紫的式神，所有自机都是射命丸文的偷拍和报纸投放对象，射命丸文和姬海棠果是竞争对手，早苗和灵梦是神社信仰上的竞争对手以及早苗单方面认为的好友（后一点不确定），正邪被以上大部分自机无视符卡规则追杀过，琪露诺“战胜”过魔理沙并得到“最强”称号，八云紫和幽幽子是前世好友，帕琪对爱丽丝的态度貌似不怎么好（虽然都是魔法使，但帕琪貌似对爱丽丝使用人偶的作战方式不怎么认可），幽香疑似与幻想乡其他大妖怪联合击败过蕾米，以上大部分自机经常在博丽神社和灵梦喝酒开宴会。
算上小数点格斗作的话，华扇和灵梦是说教和被说教的关系（华扇或是灵梦不多的信赖对象之一），萃香经常到神社找灵梦，丰聪耳神子、东风谷早苗、圣白莲、博丽灵梦是宗教信仰的竞争对手，布都是神子的手下，神奈子和诹访子是前敌后友的关系，早苗和前二位是祝与神的关系，蕾米和芙兰是姐妹，秦心原是神子制作的面具，帕琪和红魔馆众一同生活在红魔馆（帕琪和蕾米没有明确的主仆关系），帕琪一般而言看管着芙兰（早期），红美铃为红魔馆众看门（咲夜疑为其上司），二岩猯藏、射命丸文、河城荷取分别代表其种族争夺在人里的影响力（有时萃香也参与其中），神子和白莲互看不顺眼，白莲想收恋恋为徒（白莲欣赏恋恋的无意识状态，认为这是佛教所最求的空），白莲是云山的师父（白莲是住持的缘故），华扇和猯藏的关系貌似不怎么好，华扇、萃香、勇仪过去同为鬼之四天王之三（貌似），华扇有意避开萃香，比那名居天子和茨木华扇类似于官二代与草根族的关系（前者天生就是天人，后者自己修仙成为天人），铃仙和清兰都是原月兔，火焰猫燐和灵乌路空是古明地恋的姐姐古明地觉的宠物（二人也是好友），神奈子“改造”过灵乌路空，宇佐见堇子在自爆毁掉结界时被灵梦阻止（后成为神社常客），哆唻咪管理着所有梦中世界的自机，少名针妙丸是鬼人正邪的公主，少名针妙丸被灵梦养过一段时间，魔理沙经常“借”帕琪的书，小町经常不请自来到华扇仙府，犬走椛、射命丸文、姬海棠果互看不顺眼（后或有好转，一起拍过文果真报里的写真照/话说犬走椛在非想天则里出现过吗？），永江衣玖和比那名居天子或是下级与上级的关系，依神紫苑依神女苑是姐妹，萃香、文文、大狸子是深夜鲵吞亭酒友，饕餮一直想和芙兰再打一遍，梦世界铃仙曾得罪过凭依华内的所有自机。
兽王园所有角色都是自机，所以单独说（仅限本作内之间有联系的，以及之前未提及的）。蓝和饕餮是旧识，吉吊八千慧、骊驹早鬼、饕餮尤魔是竞争对手，日白残无戏耍了上面三人，日白残无一度控制了除灵梦外兽王园出现的所有自机，日白残无貌似对灵梦有特殊的看法，菅牧典意图当地狱三组长之间的多面间谍但反被残无戏耍，豫母都日狭美是残无的**粉，孙美天和三头慧之子都因残无的原因而成为妖怪或苏醒，天火人血枪与火焰猫燐相识，纳兹琳是圣白莲集团的修行者，孙美天、三头慧之子、天火人血枪是残无安排进地狱三组的间谍，骊驹早鬼曾是神子前世的马，阿吽是博丽灵梦的“看门犬”。
另外，所有自机都是博丽灵梦的退治对象。
（就这些吧，其他的想不起来了）