1887年10月1日，华人西医书院教务长孟生医生在香港大会堂宣布该院成立；10月3日，孙在香港华人西医书院（College of Medicine for Chinese, Hong Kong，今香港大学医学院）正式上课，第一课是康德黎医生讲授解剖学[28]:6。学堂隶属于伦敦传道会，由香港菁英何启出资筹办，该校教务长是苏格兰名医康德黎[30]:37。何启曾留英学习医学和法律，作《新政真诠》[22]:43。孙与康德黎师生关系密切，在校5年余，勤奋学习，除正课外广泛阅读“新学”书籍，在政治思想上受何启等维新思潮影响[22]:361。孙对达尔文之进化论发生兴趣[38]:14。

在《孙文学说》第一章，可以看到孙在大学时代潜心研究“知难行易”学说，为破除“知易行难”[29]:66-67。孙时常审视悬在壁上的中国地图，慨叹“如此江山，付之非人”

1887年冬，孙达成病笃，孙回乡伺奉汤药，孙眉闻讯亦自檀香山归，兄弟芥蒂尽释[28]:378。