补充医疗保险金专户的运作方式可能因地区和公司而异，但一般来说，这个账户类似于医保卡那样的金融账户。公司在每个季度向该账户汇入补充医疗金的金额，这可能是为了支付员工在医疗保险计划外的额外医疗费用。然而，年末查看时没有借贷发生额也没有余额的情况不太常见，可能有以下原因：1、该公司设立了专门管理补充医疗保险基金的管理部门或代理机构；2、这个账户可能在税务方面有特别的规定，要求某些交易记录不显示或有特定的处理方式；3. 这个账户也可能是出于避税或其他财务目的进行操作，具体情况需要咨询专业会计师或审计师了解详情。