首先，说一下为什么不合理。
1.在一代剧情里面，指挥官（玩家）的形象已经树立得十分鲜明了，作为身经百战，并在各种复杂，艰难的条件下找到奋斗方向，为了这个方向和目标敢于以身涉险的人，会在什么时候感到迷茫？就算目标暂时无法实现，会选择自我毁灭或自我放逐吗？

2.从剧情来看，主角并非纯粹的天真的理想主义者，就算是，也早在柏林被教育明白了。不会天天就会给你踏踏开，喊着什么友谊啊羁绊啊扑向某某某，不然早就寄在剧情里了。当然，这里面也有个问题，那就是在最后的活动剧情和之前吃瘪的剧情之间仍存在一定的空白，导致了一个很实际的问题——指挥官缺乏从一种激动的焦躁的状态转换到冷静务实的状态的自我总结和思考的过程，尽管这个部分的剧情文本并不少，但其中心偏离指挥官本人，铺垫意义多，塑造玩家形象少。
但以最后一次活动剧情为基准，可以认为，指挥官并非天真的理性主义者，至少没有——大吼一声，直扑威廉而去

3.指挥官形象应该是一个团队意识很重的人，只从剧情来看，对于自己所属的人形及同伴重视程度很高。
简单地说，从阿弗纳斯救出安洁是缺乏现实意义的事情。在第一次行动的潜入无果后，第二次大规模出动时，已经拥有了平推阿弗纳斯能力的时候，安洁能提供的情报价值几乎为零，且白教也缺乏使用其作为人质的兴趣。但剧情里面指挥官多次表达了关于救援安洁和被困ar小队成员的任务优先级。
此类案例还有很多，不再列举

所以
1.如果只是对前途感觉迷茫，感觉所做皆是无用功时，首先会做的是观望。这里有两个假设，第一个假设，指挥官已经取得了较大的权利，并成为了某人的心腹或御用打手（可能性相对较大）。在这个假设下，指挥官已经拥有相对的资源，完全可以与利用自己达成目的的上级进行一定程度的周旋，等待局势发生积极变化。
第二种假设，指挥官跟以前一样还是个无名小卒，但承接各种脏活。首先这个假设就很离谱，你丫就是赛博朋克，干个佣兵有这履历名声都打出去了，货比三家不会看嘛？非得跟着米都爆不了的爵士吗？就算是这个假设成立，那有没有一种可能，那就是“认命了”——你就是个保安头子，你拿什么更新世界啊
这里必须强调的前提是，指挥官是一个坚定的富有理想主义且经历无数生死考研的战士，不是被批评教育了就玉玉的小文青

2.如果是格里芬被强行拆解，指挥官保不住自己的小团体了。
首先不现实，抛开游戏怎么做的问题，只思考逻辑。那么爵士自宫的原因可能有很多，但从后面剧情可以看出，他仍然需要指挥官给他干活，那么他给予指挥官的交换条件是什么。一个新的职位？设身处地地想一下，一个长期在与人形而非人类打交道的人，突然要失去的自己的基本盘换去一个陌生且缺乏支持的位置，这是很难结束的条件，爵士留不住指挥官。如果要注定要拆解，也必定会允许指挥官保留一部分小团体，不然交易不成立。
第二，如果爵士和指挥官完全不对付，那么最合理的情况，不是指挥官抛下姑娘们跑路，而是带姑娘们或带一部分跑路。就算跑路黄区，在人形权利无法保证的世道下，团结跑路的格里芬也比四分五裂的孤魂野鬼好。

最后，
但是有一种情况十分特殊，那就是在既定轨迹之下，因为自身的失误或无力等原因，遭遇了重大创伤并献祭了关键角色，进而导致的自我放逐和自我封闭。这个是最合理的结局，虽然可能大部分剧情读者不愿看到此类情况，毕竟苦大仇深的。但就剧情作者而言，既然设定了自我放逐，就应当接受造成这一情况的合理性因素，不能因为大家不希望看到而不去写。更不能在一代还没有完结的时候，当谜语人，上来就这样搞，还半天不给大家讲明白为啥润了。
总结，目前指挥官自我放逐的原因仍然模糊，不清不楚，yz似乎对于慢节奏长展开叙事形成了路径依赖，这个对于只接触2代的玩家来说问题严重性并不大。但对于前作老玩家来说，就是满脑子问号和抽象话。
而且，就目前模糊的表述来看，个人认为，形成追放的角色驱动力不足，缺乏合理性。（回忆一下，你看过的各种动漫，电影里面一副灰心丧气胡子拉碴的自我放逐中年大叔的形象，是否有个中年丧x的共同点？俗套，但是合理）

以上只是恰巧失眠了一整夜的闲散人的一点拙见，至于献祭谁，谁有更好的想法，反正他们已经写完了