搞不清楚。
这些故事背景原本就只描了个轮廓，而那些墓碑更是连样子都比较简单。给人感觉补完计划这些事情不是重点。

因为SEELE底牌有王 靠着九台S2机关搭载型量产机 无论是歼灭使徒阶段玩脱了还是之后必然的反水都能修正过来 突然换人搞不好会导致投鼠忌器 当然剧中SEELE的老人不止一次扬言要炒司令鱿鱼但是实际上也只是通过副司令传达一下抱怨罢了 司令还是很有能力的 在各项计划的进度延期控制得很好 另一个则是隐瞒真相的专家 SEELE当时还需要司令的能力

因为明面上司令的最终目标和seele不冲突，只要可以顺利发动三冲，他们也就不管司令后面干什么事情了

冬月是碇唯自大学之后的导师，也是seele的技术担当，基本和eva有关的工程尤其是初号机他都有参与，关于亚当的研究冬月也有很深的参与度。碇唯挂了以后他就是初号机排序第一的保育员。
seele把冬月派到nerv新东京基地是让冬月肩负了监视碇源渡的任务的，但是冬月出于对碇唯的暗恋，和碇源渡默契的开展了合作，等于是背叛了seele。
seele组织并不在意引起三冲的究竟是谁，因为只要满足了死海文书的条件，不管是如何引发的三冲，莉莉丝都将保证契约的顺利执行。
使徒接触亚当引发三冲（例如渚薰），seele只需要派出量产机献祭刷满所需使徒数量，就会唤醒莉莉丝。
碇源渡的打算则是通过手上的亚当胚胎接触莉莉丝，同时拥有生命果实和智慧果实从而成神，绕过死海文书的限制。但是他和三代丽好感度没刷满，被拒绝了。
其实哪怕碇源渡封神也没有关系，死海文书优先被执行，实际上TV版最后莉莉丝的确没有和真嗣沟通就把几乎所有人类补完了，包括seele的那几个老头，只留下了抗拒补完的几个，甚至在被真嗣拒绝补完之后，莉莉丝一句废话都没有就“兵解”走掉了。

剧场版里部队强攻的时候里面的人就一下子明白为啥当初没给他们配备反入侵装备了，他们几个人对计划造成的损失会小于他们执行前期计划带来的便利，到时候再除掉也来得及。

我没记错的话 貌似有说过 碇唯是seele其中一个成员的女儿吧 老碇好歹算个女婿 能力履历方面也很优秀 目标上 seele只需要三冲按计划开启就行了 老碇的计划也要先开三冲 目标是重合度很高 而且冬月本身就是seele派去制衡和监视老碇的 seele一直觉得冬月是自己人 但没想到冬月跟老碇达成了一致 叛变了 而且seele手上还有底牌 觉得能最后控制局面 优势在我

seele到死都觉得自己掌控了局面

seele：无论怎么讲，会战兵力是九台对（三）两台，优势在我！

SEELE的终极目的是人类补全计划，说白了就是全体人类回到亚当体内，从而融合成神，而碇司令的计划其实是利用eva再次见到唯，顺便让自己的儿子成神（这个其实他是无所谓的，他主要是想救回唯），而双方明面上的分歧其实不大的，老银币碇司令又通过种种手段掌握了实际干活的技术圈，搞eva研究的冬月，打辅助的赤木直子和赤木律子，都被他用种种手段拉拢了，还通过各种手段打击SEELE的其他基地，比如爆炸消失的美国分部，再比如由NERV导演的核动力机器人大暴走和不得不把明日香送到日本的德国分部，说明SEELE内部斗争还是很激烈的，甚至连明日香出场时候航母战斗群军官的牢骚都是佐证，但终究还是让碇司令搞成了，抗过了一个又一个使徒的考验，终于基本凑够了成神的拼图，也就是所谓的两种果实合一，当最终的时候，SEELE派来了渚薰，因为自动驾驶搭载s2机关的傀儡机已经成熟了，SEELE拿到全部也有信心能实现人类补全计划，但最终渚薰发现了一直欺骗它的谎言，渚薰以为最终教条里面是亚当，他只要和亚当融合就能成神（使徒都是亚当的分身，回归亚当就算成神，人类也就是李林是莉莉丝的分身，亚当和莉莉丝虽然不死不灭然鹅都有弱点，所以才叫补全），结果发现那里保存的是白巨人莉莉丝，绫波丽的出现也证明了这个，也就是他融合莉莉丝毫无意义，所以干脆的让碇真嗣杀死了他的身体，等着将来人类发动所谓的第三次冲击融合成神，反正对他而言结果都是一样的，最终SEELE发动入侵战，也不过是逼迫碇司令赶紧发动冲击罢了，而碇司令也就坡下驴，真的利用大白丽引发了冲击，而这时候的莉莉丝已经是补完形态了，不但拥有智慧果实，也拥有从使徒那里夺取的生命果实，她果然按照人类的期望翻转了黑之月，也就是那个黑球，其实暗喻就是一个子宫，于是所有生命化成橙汁回到了母亲体内，而初号机其实就是亚当也顺着额头的那个带眼睛的鲍鱼进入了莉莉丝体内（地球上别的生命都是莉莉丝生的，而亚当和使徒不是，所以不通过子宫，而是从*道进入，eva毕竟不是18+，所以没法写实），后面如果莉莉丝愿意，就应该是她直接成神了，然鹅又有唯寄生的亚当（初号机）和碇司令通过绫波丽和碇真嗣成功的对莉莉丝施加了影响，于是就有了碇真嗣的补完片段，他愿意和大家合一，不受伤痛的活着就会成神，然鹅他最终依然选择了作为独立个体的人形活着，就是水波荡漾中唯、绫波丽、明日香、葛城美里同时骑在他身上那一段，听起来有点h，但是其实她们都变成橙汁了，所以才能堆叠，以及最终大家恭喜他那一段，最终大白丽也满足了他，牺牲了自己的躯体，释放了亚当，让她永远的流浪在宇宙中（亚当和莉莉丝都是不死的，唯寄生在亚当里，也是不死的，所以她才说愿意当人类存在过的标志，活在无尽的孤独中），把碇真嗣重新复原了出来，还留下同样不愿意补完的明日香，就是最终海边的一幕，倒霉蛋孩纸碇真嗣折腾了一圈，地球都毁灭了，亲友就剩另一个倒霉孩纸。。。也难怪他又抓狂掐了明日香的脖子，他好不容易自己走出了心理的阴霾，重新获得人形，结果现实那叫一个凄惨，别说是他了，换谁也难以接受。。。
索性还有莉莉丝陪着他们，也就是绫波丽的幻影。。。暗喻各种动植物还会重新繁衍出来。。。