三狗是不是可以理解为“传说人是女娲娘娘用泥捏的，但实际上我们挖掘出了人类的古代种元谋人”然后就成为了“明明人是泥巴做出来的，为什么会有猿类先祖呢？”这样的问题哈哈哈哈哈

就是真实存在的的古代未来生物啊 古代种＝化石宝可梦

首先，帕帝亚在的日英发音帕鲁迪奥，就是迪奥鲁加+帕鲁琪亚的组合，暗示这个地区和时空本来就有这紧密的联系，封面神的主题是过去和未来，剧情关键要素是时光机，完全对标七代的究极空间，就像悖论PM和究极异兽也是一组对标参考物一样，既然究极异兽是究极空间的生物，那悖论PM自然也可以是过去未来的生物，正好一个时间，一个空间。
三个问题的个人回答：
1.海哲200年前为什么能看到悖论种
——因为时光机使用了太晶能量，真正扭曲时间的正是太晶能量，DLC里北上乡中博士也因为太晶能量穿越时空了，证实了太晶能力确实可以扭曲时空实现时间穿越
2.三圣兽的古代种为什么会存在？不是有凤王复活而诞生的吗？按理来说，不应该存在古代种
——朱紫恰恰出现了【趋同演化】的概念，在整个大自然世界漫长的演化中出现类似模样但又截然不同的存在并不是荒唐的事情，而是被PM世界观确认的事情。
3.还有一个设定上的问题，为什么都不能生蛋？那么他们是如何繁殖的呢？
——蛋组未发现不代表不存在，在遥远的过去环境和现代截然不同，生物在环境改变的过程中可能造成不育，而且悖论PM在零区大量出现，人家的生育方式未必是生蛋，出芽都有可能，而且在PM世界观里，本来就设定从来没有人见过PM生蛋的瞬间，所以连PM会生蛋都是没办法被证明的，更别说悖论PM的生育方式了。

答案是时空扭曲，珍珠钻石兽打架打的，剧场版m10时空之塔原型西班牙巴塞罗那圣家族大教堂，学院好像也是取自这里，又是古代未来的，很合理吧（以上全是瞎扯的

压根啥都没填，而且图鉴也是一如既往的"猜测"(胡诌)

还有一个，朱紫之书里宝可梦合体特征的速写，到底是发生了什么才能把三只看成一只。

真正的大坑是第零区的神秘符号和超古代科技的金属，还有200年前传授海哲知识的神秘人，这些都是迷

目前来看乌龟的能力只有单纯的时光机，那我个人的想法，核心是悖谬种的悖谬单纯是只他们不存在于当下，而非以前猜测的悖谬种并不实际存在
1.200年前未灭绝的乌龟种群召唤过一次悖谬种，被海哲发现并记录，后来这些悖谬像这次的博士一样回到了原本的时代，也就解释了中间的消失
2.三狗的古代种就是原始模样，到了凤王那个时期演化成了普通动物（类似霸王龙和鸡的关系），然后烧死复活后发生了一定的返祖，这也能解释为什么这里一个水一个火能被烧死，因为他们属性退化掉了
3.不能生蛋挺正常的，可能是防止祖父悖论的出现导致穿越会失去繁殖能力，或者干脆本身就不通过两性繁殖，这种宝可梦还是挺多的

关于2有一个个人脑洞，会不会这三只也不是唯一的，而是一个种群？被凤王复活的那三只只是特例，甚至他们原本可以根本是完全无关的“普通宝可梦”，只是被转生成了圣兽（直接飞升），这样的话就没冲突了

通关dlc感觉好像讲了什么，又好像什么都没讲

2趋同演化

3是他们属于未发现蛋群，大概就是不知道能和谁生，所以你培育不出蛋这样