一般来说，动物之森的存档是和你的Nintendo Switch账户关联的，而不是与特定的卡带版本或区域相关联。因此，如果你将欧美版的游戏换成日版卡带，只要使用相同的Nintendo Switch账户登录，存档应该还在。
然而，需要注意的是，不同地区的卡带有可能会有不同的内容和限制，所以在进行更换前建议备份好当前的存档数据以防万一。此外，确保你使用的Switch支持该地区发行的游戏格式（例如NTSC、PAL等）。