对于系统盘的选择，一般来说，建议将更快的硬盘作为系统盘，因为系统盘通常需要存储大量的临时文件和系统缓存，需要更高的读写速度。
在您的情况下，由于您有两条固态硬盘，建议您将更快的硬盘作为系统盘。由于您没有提供具体的型号和规格，我无法给出具体的建议。但是，一般来说，如果两条硬盘的规格相同，那么它们的读写速度应该差不多，因此您可以根据个人偏好选择其中一条作为系统盘。
关于主板的两个插槽，一般来说，它们没有太大的差距。但是，如果您的主板支持PCIe 4.0 x4和PCIe 3.0 x4的固态硬盘，那么您需要将更快的硬盘插入到PCIe 4.0 x4的插槽中，以获得更好的性能。如果两条硬盘的规格相同，那么您可以随意插入它们到任何一个插槽中。
总之，对于系统盘的选择，建议将更快的硬盘作为系统盘，并根据主板的规格选择合适的插槽插入。