草缸运行一段时间后，缸内残留的有机废物增加，水质变坏，滋生藻类，这时就需要及时换水。开缸时硝化系统尚未建立，新水草泥释放肥力太高，开缸水可以全部不要。然后3天换一次，每次换一半，连换两到三次，根据缸内水草种植密度情况，以后每周换1/3至一半，2个月后水草状态基本稳定，这时可以每周换1/5—1/3，这样可以有效避免藻类滋生。