首先，我们引用影响记录：BAWS哨兵的最后。
影像记录中，被摧毁前拍到了作案者的机体外形，虽然很模糊，但是还是可以分析出一些东西的。
放大作案者图片，发现这家伙外形有如下特征：
整体颜色较为灰暗（也可能是摄像头原因），但肯定不鲜艳；
核心呈现下窄上宽；
左手武装与左肩武装非常小，几乎看不到；
右手武装与右肩武装非常明显，似乎一种长长的大型装备；
腿部使用双足，且双足形态是大腿细，小腿粗的正向关节，粗细对比没有过于夸张。

先考虑非AC的敌人，会与BAWS工厂牵扯的就只有PCA的LC、HC、轻装步兵和ALLMIND的隐身怪，而：
LC身材非常匀称，大小腿一边粗，核心部分上下一般粗；
HC的装备非常臃肿，左右手都有装备；
轻装步兵身材比较瘦弱，大腿比小腿粗，核心部分还是个盘子样的；
隐身怪不至于大摇大摆现身让小兵看到，而且核心是圆盘状的。

那么，排查NPC的AC档案，其中只有二周目的竞技场解析中α-1（51-001K）与β-1（51-002K，凯特·马克森同款AC）符合，其他要么四足战车腿，要么左手左肩有大型武装。

综上所述，作案者和ALLMIND脱不了关系，至于到底是这二者中的哪个，个人偏向β-1，左肩武装更小，而且是ALLMIND小号直接下场。

那么，第二工厂到底发生了什么呢？我的理解是这样的，画了个流程图。

针对上面的流程图，先回答一些可能的疑点：
Q1.AM为何要提前到达工厂，可不可以等强制监查过后再去？
A1.在探查清情况之前，AM应该不知道矿脉放着不管就会枯竭。
而假如矿脉不会慢慢枯竭而是涌出越来越多的话，这个矿脉就会影响珂若尔解放计划。要是等PCA先监察的话，PCA必会在清场之后这个矿脉上建立监视点，部署大量武力，跟监视点Δ一样，这样对解放计划不利。
Q2.为何说切断哨兵通讯的是AM？
A2.整个游戏使用过切断通讯的应该只有AM，且都在骰子线里：
在无人海上都市，与多玛扬对战时，AM会切断沃尔特的对话，直接插进和我们的频道；在珂若尔汇聚地，去打V.II的时候，路过的小兵会说自己通讯被切断。
Q3.为啥AM会找骰子线主角，不找其他线的主角？
A3.任务“防卫阔步者”中，会碰到并打败技研都市中才能遇到的敌人，这批敌人是AM派出来攻击卢解阵的阔步者。玩家到达目的地时，破坏阔步者的目的已达成，没必要因为主角消灭失去价值的棋子而对主角产生敌意，反而因为主角的强大让AM对我们产生了兴趣。这次雇佣我们也是为了判断我们是否具有参与珂若尔解放计划的资格，看看我们几斤几两。

楼上的骰子线主角和非骰子线主角我的理解是很多很多渡鸦，骰子线是接了“护卫开采舰”的渡鸦，而非骰子线是没有接上述任务的渡鸦，这里面的渡鸦不是同一个人。

这样解释的话，“妨害强制监察”和“调查第二工厂”两个任务一同揭示了AM在第二工厂的一系列行动的原因。

最后感谢一下图中这位大佬，虽然我有些观点和他有冲突，但是这位大佬的回答在大方向上给了我很大的启发，非常感谢。