1994年1月，中国足球名宿容志行、曾雪麟牵头创立深圳足球俱乐部，会员制，组队当年参加中乙，获得冠军升上甲B。1995年，深圳队获得甲B联赛冠军，冲上甲A。1997年，平安保险收购深圳队，2002年又被健力宝集团收购。2004年，深圳队夺得中超联赛冠军。夺冠后，小将郑智跟媒体人吃火锅时问：“有一支球队一年没发工资还能夺冠的吗？”

2011赛季结束，深圳队降入中甲，直到2018年才以中甲亚军的身份重返中超。
2022赛季，深圳队也是长期欠薪，阵中虽有一帮过气国脚，成绩也不行，好在有两支广州的球队、一支河北的球队长期一胜难求打底，保级也没压力。