不懂就问，自然码是最早的双拼方案吗？

不是，不过自然码是过去30年推广最成功影响力的双拼。
按照自然码的发明者周志农先生介绍，提出双拼专利的是李金铠先生，具体时间也未查到。四通打字机发明人王缉志的一篇回忆录上提到：
1985年……（后）……我在开中文信息处理会议时认识了不少研制输入法的人，当时这些人里面笔形码输入法做得比较好的有李金铠，我就去找他商量把他的输入法放在四通打字机里，他要求我们给他先支付一笔入门费，开价10万元，从当时角度看我认为高了，我们谈判了几次都没能达成协议。于是我又找其他的输入法作者，我在分析了各种输入法之后，决定去找王永民，他当时在中央统战部招待所的地下室租了个房子在搞输入法的开发，同他在一起的还有张道政。当时王永民的五笔字型输入法还没有多少人知道，我去找他商量，他比较痛快就答应了，条件我比较容易接受。他并不要求我们支付入门费，只是提出每销售一台打字机给他一个提成。于是我就同他签了一个合作协议，就这样，四通第一代打字机选用了五笔字型作为笔形码输入法。
似乎四通打字机正是1985年推出的，包含了全拼、双拼、五笔字型输入法。

四通打字机这个内置的双拼方案，后来改名叫拼音加加方案，也就是说，拼音加加可能才是最早的双拼方案，而自然码双拼第一版方案在1988年设计完成，拼音部分以当时流行的UCDOS压缩拼音为基础，经过大量统计和对比测试将常用韵母安排在最方便的地方，并且同时满足韵音与字母音相关，便于记忆。