抗生素生产包括微生物发酵、过滤、萃取结晶、提炼、精制等过程。以粮食或糖蜜为主要原料生产抗生素的废水主要来自分离、提取、精制纯化工艺的高浓度有机废水，如结晶液、废母液等，种子罐、发酵罐的洗涤废水以及发酵罐的冷却水等。

1、COD含量高
抗生素废水的COD一般都在5000～80000mg/L之间。主要为发酵残余基质及营养物、溶媒提取过程的萃取余液、经溶媒回收后排出的蒸馏釜残液、离子交换过程中排出的吸附废液、水中不溶性抗生素的发酵过滤液以及染菌倒罐废液等。这些成分浓度高，如青霉素废水CODCr浓度为15000～80000mg/L，土霉素废水CODCr浓度为8000～35000mg/L。
2、废水中SS浓度高（500～25000mg/L）
抗生素废水中SS主要为发酵的残余培养基质和发酵产生的微生物丝菌体，如庆大霉素废水SS为8000mg/L左右，青霉素废水为5000～23000mg/L。
3、成分复杂
抗生素废水中含有中间代谢产物、表面活性剂和提取分离中残留的高浓度酸、碱和有机溶剂等原料，成分复杂。易引起pH波动，影响生化效果。
抗生素废水的处理方法可归纳为以下几种：物化处理方法、好氧生物处理方法、厌氧生物处理方法以及多种方法的组合处理等。
物化法主要包括沉淀、混凝、过滤等方式。由于抗生素生产废水成分复杂，有机物含量高，同时含有少量的残留抗生素，在采用生化处理时，残留抗生素对微生物的强烈抑制作用造成废水处理过程复杂、成本高和效果不稳定。
好氧生物处理主要有SBR、氧化沟、深井曝气及接触氧化法等。