民航客机一般采用下单翼,发动机在座舱下部,噪音相对小一些,但是下单翼发动机进气扇靠近地面,容易吸入地面杂物,对机场起降条件要求高。军用运输机普遍采用上单翼,发动机位置高,正好在座舱旁边,座舱内噪音大,但优点是发动机不易吸入地面杂物,可以一定程度适应战时机场环境,对机场要求低。
另外民航客机在设计的时候更多考虑乘客的舒适性,相应的座舱和货仓布置就会有优化,军用运输机更多考虑货物的运输和卸载灵活性,在整机配重及机舱布置设计上和民航客机也是不一样的。
当然也存在军用运输机改装民航客机的例子,那也是没办法的办法。