根据辣椒的需肥规律和土壤肥力的高低，辣椒施肥要采取“重基肥，巧追肥”的原则。尤其是在辣椒移栽定植期冲施或者滴灌矿源黄腐酸钾来刺激作物生根，尤其是土壤板结严重，土壤有机质含量低更要注意增施基肥。使用添加枯草芽孢杆菌的矿源黄腐酸钾不仅能够起到抗重茬、减少土传性病害、改良土壤，更能够提高植株整体抗逆能力，比如风沙、大水等造成的茎基腐病，芽口少等现象。
辣椒本身属于浅根系作物，对于根系的要求很高，为根系发育创造一个适宜的环境，作物长势才会好。在后期追肥的同时若是不能吸收足够的营养，就会出现花少、蕾少、花而不实、蕾儿不花等不结果的症状。每年总会有一部分农户种植的辣椒出现坐果少的现象，大部分都会去补充锌肥硼肥，促进花芽分化，可以通过叶面喷施快速吸收解决，另外建议在花前使用高磷肥配合矿源黄腐酸钾（此时每亩使用200g即可），可快速有效的解决坐果少的现象。
朝天椒、红干椒、三樱椒等对于侧枝以及分叉的的要求比羊角椒和牛角椒要高，并且陆地和大棚的管理又存在差异化，在露地栽培的辣椒要着重使用含腐殖酸类的营养肥料，腐殖酸不仅能够提供改善土壤的作用，更能够调节叶片气孔，在农业市场上最早就是利用腐殖酸来达到抗旱以及调节干热风的目的。所以在管理上如何利用好腐殖酸和黄腐酸很重要。
辣椒田间增施矿源黄腐酸钾主要目的是为了改良土壤，补充有机质，增加作物长势，为辣椒高产做好基础。矿源黄腐酸钾促生根，增强光合作用，提高农产品的质量，活化土壤，破除板结，抗重茬，增殖有益菌数量，提高肥料利用率，抗酸碱度，提高产量。