我一开始也那么想，但是想了一下每个海军船坞的产量是固定的，然后生产一定量的船分不分生产线都是一样的

是边际，但在你的例子中属于错觉。你最大的问题在于，没有固定住产能总量这个条件。
讲白了就是你在拿一条船的耗时边际去套多条船的总量。
假设一条船一厂六年，二厂三年，三厂二年。从单船来看减时间收益确实是边际递减。但不代表三厂花六年做三船可以避开这个边际效应，因为三厂二年实际上做三船也是花六年。出船效率是一致的。
你所提的边际应用范围在于，资源有限船只能造一条的时候，判断该造多少船厂是合适的。但游戏里不存在只造一条船，船厂的投入成本也只有民工时间，可以忽略不计。