一些个人经验，可能不适用于大部分人，仅做一个记录。
情况说明：
通过Thunderstore mod management打了bepinexpack_gtfo等等MOD以后，通过thunderstore mode management软件打开已打MOD的游戏后，发现存档被恢复到了初始状态，仅剩A1-3可选 。
通过STEAM正常打开游戏，发现存档并没有被覆盖。
个人解决办法：
打开以下路径C:\Users\你电脑的用户名\AppData\Roaming\Thunderstore Mod Manager\DataFolder\GTFO\profiles\Default\BepInEx\plugins\GameData_23693
这个23693可能是我发帖此时此刻的游戏版本，如果游戏再次更新，可能会创造一个数字更大的文件夹例如GameData_23694等等。
在这个文件夹里找到GameData_RundownDataBlock_bin.json 这个文件，用电脑自带的记事本或者Notepad++等软件打开这个文件
查找 "Accessibility":0 ←这一串数数据（有多个），并将其中的数值0全部替换为2
效果如下：

可以看到所有关卡虽然都显示没有完成但都可以创建房间。