提一个关于移动硬盘 格式的问题 求各位兄弟解答

目前使用的是2T的硬盘
硬盘格式为NTFS
存储的文件都为500-600KB的小文件，但文件数量巨大。已经存满了10来个硬盘。
目前在使用脚本对硬盘中的文件进行规类，就是在硬盘中对杂乱的文件根据规则整理。
发现效率越来越低，每10W文件整理所用时间越来越长。
在网上看NTFS在进行大量的读取操作后会降低硬盘效率。
所以想问问兄弟们硬盘格式使用NTFS还是应该是FAT32？