1.秦琼参加了玄武门，别造谣
2.秦琼是冲将，受伤过多，后面身体恶化，很早就半退休了，别人都在进步，你半退休了，官位、爵位、封邑自然渐渐不如人。像长孙无忌太宗死了，他还活蹦乱跳的当着权臣，怎么跟人家比。秦琼恰恰是关键时刻都参与了，所以即便退休了大家也能接受放到功臣最后一位。就像花帅多年不带兵，但曾屡立大功，吕端大事不糊涂，大家也能接受把他放到元帅最后一位。

类似曹操的典韦许褚，是带着几百几千人冲锋陷阵的猛将。如果有指挥几万人的作战经历和对应的战功，待遇就不一样了。

还有说秦琼没有参加玄武门之变的，就说一件事
玄武门之前房玄龄杜如晦都已被调出了秦王府，李世民下定决心发动政变后，派人去找房杜二人来商量，房杜二人因在府外不知道李世民已经下定决心了，就说自己现在是朝廷官员不能和亲王私下来往故意激李世民，结果李世民第二次派长孙无忌和尉迟敬德拿着剑去，说如果房玄龄杜如晦不来就提着二人的脑袋回来
房杜二人对李世民来说虽然比秦琼重要的多，但毕竟是谋臣不能在第一线冲杀，而秦琼一直是李世民的金牌打手，要是敢不参加玄武门之变估计李世民会立刻将其处死，更不要说进凌源阁了
而且玄武门之变后秦琼和程咬金的封赏完全相同，秦琼封为武卫大将军实封七百户，程咬金为右武卫大将军实封七百户，说明二人都参与了政变，而且功劳相当

官小，排不进去

猛将。
但是对国家来说贡献不算很大，尤其是李世民登基以后，他就很少工作了，和程知节已经尉迟恭相比逊色，在他前面的要么是牛气冲天的，要么是皇亲国戚。

按当时官职排的并且死者为尊