我猜最终boss是暗剑本身。
原因有二，首先暗剑和光剑是最初的两把圣剑，暗剑晚于光剑诞生，没人知道它们来自何处，是绝对神秘的两把剑。
次之是感觉暗剑能让持有者预测未来的事本身就是一个陷阱，目前出了尤里以外的三位持剑人在看到暗剑给他们展示的未来（即世界被创世书毁灭）以后分别做了不同的决策，如果暗剑真的将未来展示给他们那为什么三个人做了截然不同的事，有没有可能暗剑展示的未来是虚假的，而且这三个人做的事内含逻辑。
海堂是追求绝对力量（目前看来），暗剑来诱导他背叛组织，大家都知道海堂背叛是因为追求力量，之后上条看到的拯救未来的办法是找到内鬼，因此背叛，这就让剑士们形成了接触暗剑会为追求力量而背叛的假象。之后飞羽真在没有其他人看着的情况下（除了天灾）击败了咖喱棒，并得知了上条背叛是为了拯救世界，而方法是找出内鬼，因此飞羽真也走上了和组织对立的道路。这也激化了组织中剑士们的矛盾，也就因此产生了后面内斗的剧情。
最后就是贤人，上条击败贤人后也知道他会被送去黑暗世界，在那里看到拯救世界的道路，但贤人看到了完全不同的道路，就是封印所有圣剑，只留下暗剑，才能阻止创世书毁灭世界。而在剑士内斗互相消耗体力的时候就是封印所有剑的最佳时机，当其他剑被封印，创世书被毁灭以后，就没有人有能够阻挡暗剑的力量了，这一切都是暗剑布的一场局。
当然以上都是猜想，毕竟故事才进行一半，很多设定都还没给出。但我觉得如果能有这么个剧情那就真的很nb了。而且以上猜想如果是真的，我很难定下来尤里到底在故事中扮演了什么样的人物，因为尤里是第一个持有暗剑的人，他也应该看到了未来，但尤里究竟是否知道暗剑的计划却很难下定论。