万年潜水员谈下我个人的分析。根据《终》台本的剧透，白丽和真嗣交谈虽少但十分默契，可见14年间他们是有相当程度的交流的。我们知道在Q中，真嗣从副司令处明确得知碇唯是在初号机中的，绫波是否存在则由于两方势力说辞不统一真嗣是十分疑惑的。但在里宇宙中再次进入初号机时却呼唤的是绫波而非母亲，可见在当时真嗣也是明确知道绫波在初号机插入栓中的。为什么会产生这样的矛盾呢？我认为是因为真嗣在实体化瞬间失去了lcl融合时期的记忆，这一点在TV真嗣拯救行动后，真嗣不记得融化进初号机中的记忆可以得到佐证。而进入里宇宙后，又回归了LCL化所以记忆得到恢复
站在绫波的视角，真嗣被实体化救出后绫波就认为真嗣终于不用驾驶初号机了，所以当真嗣再次回来驾驶初号机时，绫波才会说“对不起，没有给碇君不驾驶eva的幸福”
根据《破》中真嗣灵体化救出绫波后两人可以对话且还拥抱了可知，14年间两人是腻歪在一起互相交流的。这对真嗣和绫波来说互相陪伴14年就是最大幸福。
《终》的最后真嗣是以赴死的心态为众人补完的，真嗣说的话也就是遗言了。在初号机中目睹真嗣战斗的绫波不会不知道补完的具体步骤和形式，但仍不愿意离开初号机，也是想和真嗣一同牺牲。进一步推测，如果真嗣没有和黑丽在第三村的生活经历，说不定真就从了绫波，伉俪情深一同赴死，就如同老妈和司令一样。然而正是因为真嗣见证了黑丽的转变，所以坚定了绫波没有eva也能很好的生活，劝说绫波离开自己不做无畏的牺牲。
ps.Q中美里他们说绫波不在初号机中是在骗真嗣，因为如果初号机没有驾驶员的话也是无法启动的，而绫波则被当做驾驶员被他们就在了初号机插入栓中。