强直性脊柱炎发病除了与遗传因素有关外，外源性因素也可能诱发强直性脊柱炎，尽管由外源性因素引发强直性脊柱炎慢性炎症的机制并不明确，肺炎克雷伯杆菌可能是其中的候选因素之一。微生物可能通过肠道起作用，因为60%以上的强直性脊柱炎患者出现倡导的亚临床炎症改变，抗克雷伯杆菌抗体与强直性脊柱炎患者的肠道损害时密切相关的，强直性脊柱炎患者肠道克雷伯杆菌检出率增高与病情活动相关，可能由于持续性或复发性肠道感染，肠道细菌过量生长，加上粘膜通透性改变，有可能促进细菌抗原或代谢产物进入循环，激发免疫性或非免疫性炎症机制，导致关节炎症改变。也可能由于肠道某些细菌抗原成份与宿主HLA-B27分子存在着分子模式，产生交叉免疫反应导致强直性脊柱炎的发生。
寒冷、潮湿。外伤可能也是强直性脊柱炎发病的诱发因素，体内激素代谢紊乱也可能对强直性脊柱炎的发病起一定的作用，但这尚缺乏足够的证据，还需要大量的临床实验来证实。
 总之，强直性脊柱炎是一种自身免疫性疾病，具有遗传倾向，遗传及免疫因素在其发病过程中起主导作用，同时涉及感染、环境、外伤、内分泌因素，但目前对该病的发病机制还不是很清楚。进一步深入研究与强直性脊柱炎相关的致病基因及机体的免疫应答的内在依据，揭示本病的病因本病本质，从而为治疗寻找有效的方法，具有深远的意义。