2001年（219－262）
　　219 被召集的名侦探！工藤新一VS怪盗基德★
　 　220 满口谎言的委托人（前篇）
　 　221 满口谎言的委托人（后篇）
　 　222 人鱼失踪记（事件篇）
　 　223 人鱼失踪记（推理篇）
　 　224 人鱼失踪记（解决篇）
　 　226 格斗游戏的陷阱（前篇）
　 　227 格斗游戏的陷阱（后篇）
　 　228 暗藏杀机的陶艺教室（前篇）
　 　229 暗藏杀机的陶艺教室（后篇）
　 　235 地下酒窖密室◆
　 　236 南纪白滨的神秘之旅（前篇）◆
　 　237 南纪白滨的神秘之旅（后篇）◆
　 　238 大阪3K事件（前篇）
　 　239 大阪3K事件（后篇）
　 　240 新干线护送事件（前篇）
　 　241 新干线护送事件（后篇）
　 　243 毛利小五郎的冒充者（前篇）
　 　244 毛利小五郎的冒充者（后篇）
　 　245 向日葵馆的枪声◆
　 　246 陷入网中的谜团（前篇）
　 　247 陷入网中的谜团（后篇）
　 　248 疗养森林的不在场证明◆
　 　249 偶像们的秘密（前篇）
　 　250 偶像们的秘密（后篇）
　 　251 OK牧场的悲剧◆
　 　253 本厅刑事恋爱物语4（前篇）
　 　254 本厅刑事恋爱物语4（后篇）
　 　255 松江玉造连句大战十四回合（前篇）◆
　 　256 松江玉造连句大战十四回合（后篇）◆
　 　260 摇晃的餐厅◆
　 　261 雪夜的恐怖传说（前篇）◆
　 　262 雪夜的恐怖传说（后篇）◆

2002年（263－303）
　　263 大阪双重谜团 浪花剑士和太阁城★
　 　264 法庭的对决 妃VS小五郎（前篇）◆
　 　265 法庭的对决 妃VS小五郎（后篇）◆
　 　266 情人节的真相（事件篇）
　 　267 情人节的真相（推理篇）
　 　268 情人节的真相（解决篇）
　 　269 犯罪的遗物（前篇）
　 　270 犯罪的遗物（后篇）
　 　271 情急之下的应变之道（前篇）
　 　272 情急之下的应变之道（后篇）
　 　274 幽灵屋的真相（前篇）
　 　275 幽灵屋的真相（后篇）
　 　282 水流石庭的玄机（前篇）◆
　 　283 水流石庭的玄机（后篇）◆
　 　284 中华街的雨中幻影（前篇）
　 　285 中华街的雨中幻影（后篇）
　 　286 工藤新一纽约事件（事件篇）
　 　287 工藤新一纽约事件（推理篇）
　 　288 工藤新一纽约事件（解决篇）
　 　289 光彦森林迷失记（前篇）
　 　291 孤岛的公主与海龙宫（事件篇）
　 　292 孤岛的公主与海龙宫（探索篇）
　 　293 孤岛的公主与海龙宫（解决篇）
　 　294 爱与决断的冲击（前篇）◆
　 　295 爱与决断的冲击（后篇）◆
296 屋形船海钓记◆
　 　297 法庭的对决Ⅱ 妃VS九条（前篇）◆
　 　298 法庭的对决Ⅱ 妃VS九条（后篇）◆
299 关门海峡的友情与杀机（前篇）◆
300 关门海峡的友情与杀机（后篇）◆

2003年（304－344）
　　304 震动的警视厅 1200万名人质★
　 　305 看不见的嫌疑人（前篇）
　 　306 看不见的嫌疑人（后篇）
　 　307 遗留下来的无声证言（前篇）
　 　308 遗留下来的无声证言（后篇）
　 　309 与黑色组织的接触（交涉篇）
　 　312 夕阳染红的女儿节人偶（前篇）（被提到）
　 　314 扶手损毁的瞭望台◆
　 　315 阳光普照的地方◆
　 　316 被玷污的蒙面英雄（前篇）
　 　317 被玷污的蒙面英雄（后篇）
　 　318 幸运的雪茄盒（前篇）◆
　 　319 幸运的雪茄盒（后篇）◆
　 　323 服部平次一筹莫展！（前篇）
　 　324 服部平次一筹莫展！（后篇）
　 　325 火焰中的红马（事件篇）
　 　326 火焰中的红马（搜查篇）
　 　327 火焰中的红马（解决篇）
　 　328 生日葡萄酒之谜◆
　 　330 金钱买不到的友情（后篇）（回忆）
　 　331 充满疑惑的辣味咖喱（前篇）
　 　332 充满疑惑的辣味咖喱（后篇）
　 　333 相似的两位公主（前篇）
　 　334 相似的两位公主（后篇）
　 　337 坠落事件的内幕◆
　 　338 四辆保时捷（前篇）
　 　339 四辆保时捷（后篇）
　 　340 厕所里隐藏的秘密（前篇）
　 　342 豪斯登堡的新娘★◆
　 　343 便利商店的陷阱（前篇）
　 　344 便利商店的陷阱（后篇）

2004年（345－383）
　　345 与黑衣组织直面对决 满月之夜的双重谜案★
　 　346 寻找屁股上的印记（前篇）
　 　348 爱、幽灵和地球遗产（前篇）◆
　 　349 爱、幽灵和地球遗产（后篇）◆
　 　351 被遗忘的手机（后篇）
　 　352 钓鱼大赛的悲剧（前篇）◆
　 　353 钓鱼大赛的悲剧（后篇）◆
　 　354 小小的委托人（前篇）
　 　355 小小的委托人（后篇）
　 　356 怪盗基德令人惊异的空中漫步★
　 　357 恋人是春天的幻影◆
　 　361 帝丹高中校园灵异事件（前篇）
　 　362 帝丹高中校园灵异事件（后篇）
　 　364 心灵相通杀人事件（前篇）◆
　 　365 心灵相通杀人事件（后篇）◆
　 　368 魔女栖息的糖果之家◆
　 　371 沉默的航线（前篇）
　 　372 沉默的航线（后篇）
　 　376 限时15时◆
　 　379 温泉雪夜长袖和服事件（前篇）◆
　 　380 温泉雪夜长袖和服事件（后篇）◆
　 　381 谁的推理秀（前篇）
　 　382 谁的推理秀（后篇）
　 　383 甲子园的奇迹！绝不能输给看不见的恶魔★

2005年（384－424）
　　384 目标毛利小五郎◆
　 　385 斯特拉迪瓦里小提琴的不和谐音（前奏曲）
　 　386 斯特拉迪瓦里小提琴的不和谐音（间奏曲）
　 　387 斯特拉迪瓦里小提琴的不和谐音（尾奏曲）
　 　388 醉倒在萨摩的小五郎（前篇）◆
　 　389 醉倒在萨摩的小五郎（后篇）◆
　 　392 谜样的身高差距20厘米◆
　 　398 奇妙一家的委托（前篇）
　 　399 奇妙一家的委托（后篇）
　 　400 心存疑惑的兰◆
　 　401 珠宝强盗现行犯（前篇）
　 　406 柯南和平次的推理魔术（机关篇）
　 　407 柯南和平次的推理魔术（宅第篇）
　 　408 柯南和平次的推理魔术（解决篇）
　 　409 舞台剧和绑架案同步进行（前篇）◆
　 　410 舞台剧和绑架案同步进行（后篇）◆
　 　411 神社鸟居之惊人暗号（前篇）
　 　412 神社鸟居之惊人暗号（后篇）
　 　415 佛灭日出现的恶灵（事件篇）
　 　416 佛灭日出现的恶灵（疑惑篇）
　 　417 佛灭日出现的恶灵（解决篇）
　 　418 米花町阁楼之家◆
　 　419 八岐大蛇的剑（前篇）◆
　 　420 八岐大蛇的剑（后篇）◆
　 　422 银杏色的初恋（后篇）

2006年（425－459）
　　425 黑色冲击！组织魔爪伸来的瞬间★
　 　426 给小兰的情书◆
　 　428 超机密的上学路（后篇）
　 　429 无法回头的二人（前篇）
　 　430 无法回头的二人（后篇）
　 　431 本厅刑事恋爱物语7（前篇）
　 　432 本厅刑事恋爱物语7（后篇）
　 　434 名犬库儿的功劳◆
　 　437 上户彩与新一 4年前的约定◆
　 　438 鱼邮件追踪记
　 　441 通向死亡的“啊”◆（未正面登场）
　 　445 俄罗斯蓝猫的秘密
　 　446 被封印的欧式窗（前篇）
　 　447 被封印的欧式窗（后篇）
　 　449 本厅刑事恋爱物语 虚假的婚礼★
　 　450 诡计VS魔术（前篇）◆
　 　451 诡计VS魔术（后篇）◆
　 　452 金毗罗剧院魅影★◆
　 　457 园子的红手帕（前篇）
　 　458 园子的红手帕（后篇）

2007年（460－490）
　　462 黑衣组织的影子 小小的目击者
　 　463 黑衣组织的影子 奇妙的照明
　 　464 黑衣组织的影子 谜样的高额报酬
　 　465 黑衣组织的影子 珍珠流星
　 　469 怪盗基德与四幅名画（前篇）
　 　470 怪盗基德与四幅名画（后篇）
　 　471 失控的租赁汽车◆
　 　472 工藤新一少年冒险（前篇）
　 　473 工藤新一少年冒险（后篇）
　 　474 妃英理律师之恋
　 　478 真实的30分钟◆
　 　479 与服部平次共度的3天★
　 　482 山妖婆婆的利刃（后篇）
　 　484 黑色照片的去向（前篇）
　 　487 本厅刑事恋爱物语8 左手的无名指★
　 　488 电视台的恶魔★
　 　489 法庭的对决Ⅲ 目击者是检察官★◆
　 　490 服部平次VS工藤新一 滑雪场的推理对决★
2008年（491－520）
　　491 红与黑的碰撞 开端
　 　492 红与黑的碰撞 血缘
　 　493 红与黑的碰撞 绝叫
　 　494 红与黑的碰撞 冥土
　 　495 红与黑的碰撞 昏睡
　 　503 红与黑的碰撞 决死
　 　505 律师妃英理的证言（前篇）
　 　506 律师妃英理的证言（后篇）
　 　507 卡拉OK包房的死角（前篇）
　 　508 卡拉OK包房的死角（后篇）
　 　509 红白黄色与侦探团（回忆TV 325）
　 　510 柯南VS双重暗号之谜
　 　511 推理对决！新一VS冲矢昴
　 　512 破碎的星座图◆
　 　513 杀意源自咖啡之香（前篇）
　 　514 杀意源自咖啡之香（后篇）
　 　515 怪盗基德的瞬间移动魔术★
　 　516 风林火山 迷宫的铠甲武士★
　 　517 风林火山 阴和雷霆的对决
　 　518 明治维新神秘之旅（探索篇）◆
　 　519 明治维新神秘之旅（解读篇）◆
　 　520 酒红色的告发◆

2009年（521－561）
　　521 杀人犯 工藤新一★
　 　522 新一的真实身份与小兰的眼泪★
　 　523 真正想问的事
　 　524 憎恨的蓝色火花（前篇）
　 　526 真凶送来的礼物
　 　527 假面戏剧中隐藏的恶意◆
　 　528 以柔制谜（前篇）
　 　529 以柔制谜（后篇）
　 　530 都市传说的真相（前篇）
　 　531 都市传说的真相（后篇）
　 　532 初恋的伤痕
　 　533 呼唤过去的伤痕
　 　537 怪盗基德VS最强金库（前篇）
　 　538 怪盗基德VS最强金库（后篇）
　 　539 给愚蠢者的遗产◆
　 　540 毛利小五郎侦探停业的日子（前篇）◆
　 　541 毛利小五郎侦探停业的日子（后篇）◆
　 　544 弹奏不和谐音符之手◆
　 　545 雾中尖叫的魔女（前篇）
　 　546 雾中尖叫的魔女（后篇）
　 　547 与犯人共度的两天（第一天）◆
　 　548 与犯人共度的两天（第二天）◆
　 　553 THE 问讯室◆
　 　554 鹳的探索之旅（搜索小兰篇）◆
　 　555 鹳的探索之旅（追踪阳菜篇）◆
　 　556 恐怖的交叉路口◆
　 　557 与危险的二人同行
　 　558 死亡之馆 赤壁（三顾之礼）
　 　559 死亡之馆 赤壁（掌中之物）
　 　560 死亡之馆 赤壁（死者孔明）
　 　561 死亡之馆 赤壁（空城之计）

2010年（562－601）
　　562 彩虹色的绑架◆
　 　565 没有看见的目击者◆
　 　566 搭档是圣诞小子◆
　 　567 降落在露天浴场的杀意◆
　 　570 证实几率为零的犯罪◆
　 　573 难为情的护身符的去向（前篇）
　 　574 难为情的护身符的去向（后篇）
　 　575 黑色连衣裙的不在场证明（前篇）
　 　576 黑色连衣裙的不在场证明（后篇）
　 　578 召唤危机的红色前兆
　 　579 黑与13的暗示
　 　580 逼近的黑色时刻
　 　581 红色的摇摆目标
　 　582 僵尸死亡之夜◆
　 　586 黑暗中消失的麒麟之角
　 　588 屋顶农场的陷阱◆
　 　589 最糟糕的生日（前篇）
　 　590 最糟糕的生日（后篇）
　 　592 猴子与熊手的捕物帖（前篇）
　 　593 猴子与熊手的捕物帖（后篇）
　 　594 广岛宫岛的七大不可思议之旅（宫岛篇）◆
　 　595 广岛宫岛的七大不可思议之旅（广岛篇）◆
　 　596 坠落的不在场证明◆
　 　599 正义的伙伴◆
　 　600 梦中遇见河童（前篇）
　 　601 梦中遇见河童（后篇）

2011年（602－641）
　　602 潜伏在网球场的恶魔◆
　 　603 降灵会双重密室事件（第一密室）◆
　 　604 降灵会双重密室事件（第二密室）◆
　 　605 降灵会双重密室事件（密室开放）◆
　 　606 法庭的对决Ⅳ 陪审员小林澄子（前篇）◆
　 　607 法庭的对决Ⅳ 陪审员小林澄子（后篇）◆
　 　608 背叛的白色情人节（前篇）
　 　609 背叛的白色情人节（后篇）
　 　610 被害者是工藤伸壹
　 　611 犬伏城 炎之魔犬（鬼火之章）
　 　612 犬伏城 炎之魔犬（足迹之章）
　 　613 犬伏城 炎之魔犬（公主之章）
　 　616 福尔摩斯的默示录（名侦探的弟子）
　 　617 福尔摩斯的默示录（Love is 0）
　 　618 福尔摩斯的默示录（撒旦）
　 　619 福尔摩斯的默示录（Code break）
　 　620 福尔摩斯的默示录（草场女王）
　 　621 福尔摩斯的默示录（0 is Start）
　 　622 紧急事态252（前篇）（回忆中出现）
　 　625 惊叫手术室（前篇）
　 　626 惊叫手术室（后篇）
　 　627 柯南基德的龙马宝物攻防战（前篇）
　 　628 柯南基德的龙马宝物攻防战（后篇）
　 　629 宣传片拍摄事件（前篇）◆
　 　630 宣传片拍摄事件（后篇）◆
　 　631 花时钟知道一切◆
　 　632 时间守护者的剑（前篇）
　 　633 时间守护者的剑（后篇）
　 　634 犯罪现场在超狭小的店◆
　 　635 减肥时要当心◆
　 　636 世界上最想学习的课程事件（前篇）◆
　 　637 世界上最想学习的课程事件（后篇）◆
　 　638 在红叶御殿解开谜题（前篇）◆
　 　639 在红叶御殿解开谜题（后篇）◆
　 　640 8枚素描记忆之旅（冈山篇）◆
　 　641 8枚素描记忆之旅（仓敷篇）◆