首先并不是飞船。方舟计划的第一阶段是寻找可以地球化的外星球,第二阶段是由重型机器完成外星球地球化,第三阶段是在地球化完成后,制造复制人,复制人在赛博空间生活18年亲历人类文明,再用两年学习专业知识,20岁时离开培养仓,延续人类文明。所以他们十五人在一开始就已经在地球化了的外星上了。
至于保卫扇区,是因为2188年的东云谅子博士对人类绝望,对赛博空间的代码动了手脚,让以重型机械为原型的机械怪兽戴莫斯在十五人16岁时大举进攻。因为戴莫斯压制全部地下UFO也就是万物中枢时,会引发赛博空间重置,让十五人在扇区内重新回到刚出生的状态重新来过,又因为戴莫斯的科技力和战斗力是2188年的水平,而五个扇区最先进的时代也只是2105年,理论上绝对没法抵抗戴莫斯的攻击,所以这十五人理论上永远也不可能生活到18岁,更永远不可能离开培养舱。东云谅子博士试图用这种方法使方舟计划阶段三一直循环,最终无法完成,以到达她希望的人类文明灭绝。
抵抗怪兽,保护扇区的意义就在于为了拖延时间,让万物中枢有机会发觉阶段三出了问题,采取应急措施将15人强行脱出赛博空间,以终止这种无限循环