0·前言
好久不见！
时隔3年，我宣布卡尔达肖夫和雏菊世界那两个坑现状如下：

我当然十分睿智地没有留任何备份！
难道你会给你中二时期写的**贴子备份吗？
所以我名正言顺地弃坑了！！
我真的有打算更新来着
可喜可贺，可喜可贺
然后今天开个新坑，讲讲如何自己在家里XJB搞科研。
具体来说，是搞生物学研究。
再具体一点，是搞分子进化研究。
这种研究很有趣，说得简单一点，是利用数据和模型进行的物种演化模拟——
不妨把它理解成Rewrite中月球线里瑚太朗一行人搞的那个模拟地球游戏，也有点像“可能性的系统树”。
本文就是介绍如何自己在家里研究生物进化的历史。

但由于我的水平非常非常有限，可能讲不到那么往后就自己先懵逼了。
因此随缘更新，随时弃坑。
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1·正经的科研、瞎搞的科研、XJB搞的科研
科研是啥？
简单一点来说，是提出一个科学问题，通过研究解决它的过程。
中学理科课本上教的的科研流程是这样的：

这种科研叫做“瞎搞的科研”。
为啥呢？因为是真的瞎，瞎猫撞死耗子那种瞎。
我不是针对谁，而是说在座的各位，你们的智力和观察力并不会比其他高出太多，因此你所提出的问题，有99%已经有别人提出过。
而其中已经有（完整的或部分的）研究成果的，少说也有80%。
因此，如果提出问题后，不检索一下相关研究成果，而是直接开始闭门造车，其结果往往是很快就（或者搞到最后才）遗憾地发现，自己只是重复了一边别人的研究。
所以，“正经的科研”依赖于大量阅读文献，反复提出问题，二者循环往复，直到文献已经无法完全解释你所提出的的问题，才开始进行后面的步骤。
而在做后面的每一步之前，都需要再次阅读大量文献，以确保自己这一步准确无误。
因此“正经的科研”大致是这样的：

看起来十分恐怖。
幸好大部分论文都十分人性化，不仅研究背景、实验方法、研究结论等条目清晰，且都会自己总结出“摘要”供人直观了解研究内容。
因此阅读文献比阅读散文要快多了。
才怪。
阅读文献可以说是科研过程中最痛苦的一步——尤其是尖端的基础科学研究。
你可能需要不断地一步一步顺着文献的“参考文献”往上爬，阅读数十甚至上百篇文献，才能够大致了解你的研究领域中一个并非你研究专长的方向，从而开展你自己的研究。
所以博士（不限男女）不好找对象的原因并不完全是因为秃，也可能是因为他（她）有顺着你的浏览记录聊天记录什么的把自己对象的前对象、前前对象、前前前对象、初中相好、小学初恋啥的全给刨出来的职业习惯。
然后对象还不好找他（她）的把柄。
因为读博的大多没啥恋爱史。
阅读文献太痛苦了。
所以我们才会搞XJB搞的科研。
大致是这样的：

拿着自己以前的数据或者别人用不上的数据XJB分析一下，随便得出点什么不一定正确的鬼结论。
不需要读文献，不需要有研究目的，不需要定实验计划，只有搞事。
而且万一搞出了不得了的结论，可以直接后补上问题和计划，再XJB补读几篇文献，兴许能发个1、2分的论文。
搞科研的一般会把XJB搞科研当做摸鱼，因为是真的爽——当然有的也是为了搞正经的科研提供思路。
而进化生物学研究是最适合XJB搞科研的方向了。
因为“别人的数据”很多，非常非常多。
取之不尽用之不竭。
这都得归功于将自己研究成果无私分享的科学家们，以及大洋彼岸一家科研机构：美国国家生物技术信息中心。
通称NCBI