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human RefSeq

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RefSeq:即Reference Sequence,翻译成:参考序列


2025-08-03 17:52:18
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RefSeq(参考序列)数据库是一个开放存取、公开注释的公共收藏核苷酸序列(DNA、RNA)及其蛋白质产品。这个数据库是由国家生物技术信息中心(NCBI)建立,并且,不像基因银行为每个主要生物分子(即DNA、RNA或蛋白质)提供一个单一记录,用于从病毒到细菌到真核生物的主要生物。
针对每一个典型生物,RefSeq目的是为基因组DNA、基因转录物和由这些转录物产生的蛋白质提供单独和连锁的记录。RefSeq仅限于能够获得足够数据的主要生物体(超过66000个不同的命名有机体,截至2011年9月);同时基因银行包括提交的任何生物体的序列(大约250000种不同命名的生物体)。


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NCBI的参考序列(RefSeq)计划,为多种生物提供序列的数据信息及相关资料,用于医学、基因功能和基因功能比较研究。RefSeq数据库中所有的数据是一个非冗余的、提供参考标准的数据,包括染色体、基因组(细胞器、病毒、质粒)、蛋白、RNA等。


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RefSeq和genbank的数据的区别
genbank是一个开放的数据库,对每个基因都含有许多序列。很多研究者或者公司都可以自己提交序列,另外这个数据库每天都要和EMBL和DDBJ交换数据。genbank的数据可能重复或者不准。
而RefSeq数据库被设计成每个人类位点挑出一个代表序列来减少重复,是NCBI提供的校正的序列数据和相关的信息。数据库包括构建的基因组contig、mRNA、蛋白和整个染色体。refseq序列是NCBI筛选过的非冗余数据库,一般可信度比较高。


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RefSeq记录的特征:
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格式及说明:
巴拉巴拉


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RefSeq记录步骤创建:1. 2. 3. 4.


2025-08-03 17:46:18
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RefSeq记录三种可以获得的状态:预测。 临时。 检查过的。 巴拉巴拉...


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提供的分子类型和基因组:
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3.
4.
5.
6.
再巴拉巴拉...


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