中文名：守门海妖 
英文名：Doppler Octopus 
攻击方式：导弹攻击 
制造人：多普勒博士----------Dr•Doppler 
特效武器：三叉雷电（Triad Thunder） 
介绍：为进行水攻作战而设计，章鱼还是水母型的机体。以各式飞弹机攻击，在霸法战死的情况下才出现的隐藏BOSS。

中文名：伊雷基恩 
英文名：Eregion 
攻击方式：利爪攻击/雷磁弹攻击 
制造人：西格玛--------------Sigma 
特效武器：普通攻击/普通攻击 
介绍：袭击天空之城的故障者军。又袭击了改造军团（黑白两面通吃…），并带走爱莉斯。是谁为了什么制造了伊雷基恩呢？成为了一个无人知晓的问题。要注意其巨大的爪子的攻击，及从口中射出的雷磁弹。

中文名：爆炎龙骑 
英文名：Magma Dragoon 
称号：爆炎之武斗家 
X武器：飞升焰（Rising Fire） 
Zero武器：龙炎刃（Ryuenjin / Dragon Flame Blade） 
制造人：西格玛-----------Sigma 
X克制：冰霜海象/死神西格玛形态1---Frost Walrus/Death Sigma Part1 
Zero克制：冰霜海象/骇客孔雀/死神西格玛形态1---Frost Walrus/Cyber Peacock/Death Sigma Part1 
X特效武器：双重旋风（Double Cyclone） 
Zero特效武器：疾风牙（Shippuuga / Hurricane Fang），雷神击（Raijingeki / Thunder God Attack） 
介绍：第14乱斗特殊部队及火山部队前任队长，对武术有精湛研究的思考型机械人。由于想和自己所尊敬的X战斗，在西格玛的劝诱下离开猎人部队而攻占火山，并将前来寻找自己的猎人一一清除（也是他最后将改造军团叛乱的幕后真相告诉给X…）

中文名：冰霜海象 
英文名：Frost Walrus 
称号：极北之暴徒 
X武器：冰霜塔击（Frost Tower） 
Zero武器：冰烈斩（Hyouretsuzan / Ice Fury Slash） 
制造人：改造军团----------Repliforce 
克制：喷射飞魟-----Jet Stingray 
X特效武器：飞升焰（Rising Fire） 
Zero特效武器：龙炎刃（Ryuenjin / Dragon Flame Blade） 
介绍：过去曾经因为被判定为故障者而遭处刑，但被陆军上将看出了其潜力而吸收为特别部队成员，认为军人的职责在于搞破坏，也因而很乐于在任务中进行大规模的暴力行为。

中文名：喷射飞魟 
英文名：Jet Stingray 
称号：深海破坏者 
X武器：猎地枪（Ground Hunter） 
Zero武器：飞燕脚（Hienkyaku / Flying Swallow Legs） 
制造人：改造军团-----------Repliforce 
X克制：狂爪凶兽--------------Slash Beast 
X特效武器：冰霜塔击（Frost Tower） 
Zero特效武器：冰烈斩（Hyouretsuzan / Ice Fury Slash），空圆舞（Kuuenbu / Sky Waltz） 
介绍：改造军团海军的成员，认为陆军上将与卡尼鲁是军人的典范而崇敬他们，引爆了海岸都市的地下动力部后逃往自己海上的基地。

中文名：狂爪凶兽 
英文名：Slash Beast 
称号：钢铁之破坏王 
X武器：双重斩杀（Twin Slasher） 
Zero武器：疾风牙（Shippuuga / Hurricane Fang） 
制造人：改造军团-----------Repliforce 
X克制：电网蜘蛛/陆军上将------Web Spider/General 
Zero克制：爆炎龙骑----------------Magma Dragoon 
X特效武器：猎地枪（Ground Hunter） 
Zero特效武器：空圆舞（Kuuenbu / Sky Waltz） 
介绍：在改造军团中数一数二的暴力狂，为了想要大闹天下而加入改造军团。是个可以让任何敌人都惧怕的勇猛战士（俗称猛男…- -）被分派进行军用补给火车的调度与守备工作（相当于“跑车的”…）

中文名：原始西格玛 
英文名：Sigma 
攻击方式：发射能源弹，喷射激光 
制造者：不详 
特效武器：普通攻击 
介绍：由于在第4次故障机械人大战中的身体被摧毁，新的身体还未完成之前，以病毒的形态侵入了城市的自由女神像，摧毁了X的终级装甲（或Zero的手炮），利用转播战斗实况的转播系统瞬间将病毒传播到世界各地。

中文名：新月灰熊 
英文名：Grizzly Slash 
称号：暴走的铁爪 
X武器：新月射击（Crescent Shot） 
Zero武器：三日月斩（Mikazukizan / Crescent Moon Slash） 
制造者：不详 
克制：海汐鲸/混乱壁画II-----Duff McWhalen / Rangda Bangda II 
X特效武器：刺球（Spike Ball） 
Zero特效武器：双梦幻（Sogenmu / Twin Phantasm） 
介绍：黑市军火商人，从以前就是过着借打斗取得战利品，再贩售牟利的生活，最近则变成了中介商的身份而比较没能进行战斗，右眼的伤是过去伤于Zero手中，因此一直肆机向Zero复仇。

中文名：海汐鲸 
英文名：Duff McWhalen 
称号：大海的守护神 
X武器：吉尔刀（Gel Shaver） 
Zero武器：飞水翔（Hisuisho / Flying Water Soar） 
制造者：不详 
克制：闪电乌贼/混乱壁画II---Squid Adler / Rangda Bangda II 
X特效武器：新月射击（Crescent Shot） 
Zero特效武器：三日月斩（Mikazukizan / Crescent Moon Slash） 
介绍：海洋博物馆的馆长，同时也是海洋警备备的队长，由于对海洋有强烈的责任心，因此常与改造军团海军发生冲突。

中文名：闪电乌贼 
英文名：Squid Adler 
称号：超电磁的陷阱 
X武器：三叉雷电（Tri-Thunder） 
Zero武器：电刃（Denjin / Electric Blade） 
制造者：不详 
克制：亮光萤火虫/影恶魔/混乱壁画II/精神西格玛--Izzy Glow/Shadow Devil/Rangda Bangda II/Phycho Sigma 
X特效武器：吉尔刀（Gel Shaver） 
Zero特效武器：飞水翔（Hisuisho / Flying Water Soar） 
介绍：前第6舰队队员，因为对自己的工作感到疑问而辞职，之后就进行和平的能源研究工作，身上的触手是自己正在实验的强力发电装置。对鱼雷章鱼似乎有特殊的情感（[[0_0]]|||BL…）

中文名：亮光萤火虫 
英文名：Izzy Glow 
称号：知性的光辉 
X武器：萤火虫激光（Firefly-Laser） 
Zero武器：灭闪光（Messenko / Destruction Flash） 
制造者：不详 
克制：暗黑蝙蝠------------Dark Dizzy 
X特效武器：三叉雷电（Tri-Thunder） 
Zero特效武器：电刃（Denjin / Electric Blade） 
介绍：雷射研究的一代宗师，堪称地球第一的雷射学者，但害怕自己的研究被挪为军事所用，始终没有公开他的研究成果，反而还将实验室包藏在古城当中。

中文名：暗黑蝙蝠 
英文名：Dark Dizzy 
称号：忘却的暗战士 
武器：暗黑停顿（Dark Hold） 
制造者：不详 
克制：旋翼飞马-----------The Skiver 
X特效武器：萤火虫激光（Firefly-Laser） 
Zero特效武器：灭闪光（Messenko / Destruction Flash） 
介绍：三年前由西格玛制造的机械人，由于战力不大而不被西格玛重视，甚至无视于他的临阵脱逃，这次以西格玛忠实部下的身份再次出现。

中文名：旋翼飞马 
英文名：The Skiver 
称号：天空的王子 
X武器：盘旋翼（Wing Spiral） 
Zero武器：飓风（Shippuu / Hurricane） 
制造者：不详 
克制：燃烧暴龙----------Mattrex 
特效武器：暗黑停顿（Dark Hold） 
介绍：改造军团空军新任的指挥官，正义感强劲，但因年轻而时常感情用事。尊敬前次战争中战死的卡尼鲁。

中文名：燃烧暴龙 
英文名：Mattrex 
称号：侏罗纪的暴君 
X武器：地火（Ground Fire） 
Zero武器：断地焰（Danchien / Severing Ground Flame） 
制造者：不详 
克制：尖刺红玫瑰/混乱壁画II/X--Axle the Red/Rangda Bangda II/X 
X特效武器：盘旋翼（Wing Spiral） 
Zero特效武器：飓风（Shippuu / Hurricane） 
介绍：改造军团灾害对应小组的组员，被派任到火山地带监测，就依着自己的兴趣建了武器仓库，以火山能源大量制造武器。

中文名：尖刺红玫瑰 
英文名：Axle the Red 
称号：真红的幻术 
X武器：刺球（Spike Ball） 
Zero武器：双梦幻（Sogenmu / Twin Phantasm） 
制造者：不详 
克制：新月灰熊/终级西格玛--Grizzly Slash/Final Sigma 
X特效武器：地火（Ground Fire） 
Zero特效武器：断地焰（Danchien / Severing Ground Flame） 
介绍：由丛林的自动控制装置与思考型机械人融合而产生的机器，又被西格玛病毒感染后，变成了变异型非正规机器，由于其变异的过程仍有许多不明了的地方，因此也拥有令人惊异的能力。