生化3毕竟比生化2制作的晚是无需质疑的！所以不管是原版生化2和重制版生化2的各种不合理都和3的联系上都被生化3的各种不合理给霍霍了！那么生化3的各种设定和原版生化2时间线的冲突不合理有以下几点：
1、开头的CG动画到底发生在几月几号？看CG就是一个晚上发生的事，如果和2联系上就应该是同一天的夜晚！
不合理的点：隔了几个夜晚，生化2去加油站和警局居然还有活人？看那个CG浣熊市早就成炼狱了！
2、生化3发生在9月28日的下午，吉尔开始行动！行动没多长时间，和布莱德相遇，看见布莱德在酒吧被咬！然后追到警察局，又看到布莱德被追踪者击杀！
不合理的点：布莱德感染丧尸的可能性慢点，但追踪者的击杀能把布莱德彻底摧毁啊！为什么布莱德还能变成丧尸？即便之后能变成丧尸，为啥吉尔不能去布莱德徘徊的走廊？
3、生化3吉尔进警局到西侧办公室碰见一堆丧尸和昏迷的马文，而后吉尔去自己的办公室的路上有大量的丧尸！
不合理的点：马文昏迷在办公室被好几个溜达的丧尸无视？
4、吉尔在新闻记者室内看见封城的设定！肯定时间是28日封的城！
不合理的点：都封城了，卡车司机和里昂及克拉尔是如何大摇大摆进城的？
5、生化3发生了3天！居然基本全是黑天！就刚开始到酒吧算是一个白天！
不合理的点：吉尔就那么短的路发生了两天外加昏迷一天！追追被打退一次能休息多长时间？在钟楼吉尔受病毒昏迷，追追无视吉尔和卡洛斯对打？追追硬等着吉尔昏迷了一天？3天了居然还找不到和克莱尔和里昂怎么进来的一条路？28日了无出口？里昂和克莱尔怎么进来的，吉尔连怎么出都不知道？