还有第三层大断层里卡住的船，很可能是探险队三贤的船。而已知的1900年里小岛并没有发生大型灾难（下沉之类的），可以推测三贤的到来早于1900年前，当时他们到达的“地表”就是如今的第三层，这也解释了为什么探险队碰到原住民后就轻松下到第五层。
我觉得作者在最初画漫画时就埋了很多暗线，整体的情节框架都是仔细计划过的，也就是说之后的重要剧情也可能源于在之前最初几章埋的伏笔。大家快去找啊！