Perl，samtools，bam使用问题如图，IN打开了一

Perl，samtools，bam使用问题
如图，IN打开了一个bam文件，写入到OUT中，但是这样子OUT的new4.bam不是bam格式，要怎么弄才可以让它也是保留着bam格式呢？请教一下各位

你要提取-H内容的话可以直接在perl里调用linux命令，在samtools之后使用--output-fmt指定bam格式输出到文件就行了，不需要open再输出

不感兴趣

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可以给一个例子看看嘛？

楼主是学基因组的么？想交流一下

是学基因组的

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