brain_products吧 关注:20贴子:18
  • 3回复贴,共1

BrainVision Analyzer 2中的Marker标记

只看楼主收藏回复

为什么需要marker?
科学研究在数百毫秒内发生的电生理活动需要精确锁时的触发,可用于实验的分段平均叠加。(具体如何标记marker,可参看《E-prime主要常见问题及matlab、python打marker方式》)eg:做EEG时加上特定的事件诱发,就可以做到ERP(事件相关电位),此处的事件就是需要使用标记来分类。关于ERP内容可参见《脑电事件相关电位》
本文将概述如何在BrainVision Analyzer 2中最有效地管理,编辑和处理标记。
了解marker
首先,我们来看一下analyzer 2中marker数据的结构。使用Brain Products的脑电设备采集的数据通常会有三个文件:EEG数据文件( .eeg),BrainVision头文件(.vhdr)和BrainVision标记文件(.vmrk)。这三者中的.vmrk文件是包含所需的marker信息文件。实际上,只有在第一次读取原始文件时,才会读取标记文件一次。然后将所有标记信息嵌入到新创建的history file文件中。通过记事本软件可直接打开.vmrk标记文件,打开后如下图。

图1:BrainVision标记文件(.vmrk)。颜色编码是指标记属性含义。
Mk <标记号> = <类型>,<描述>,<数据点中的位置>,<数据点中的大小>,
<通道号(0 =标记与所有通道相关)>,<日期(YYYYMMDDhhmmssuuuuu)>。
Position in data points:这个是标记的关键信息,因为它决定了标记的确切位置。对于各种与事件相关的实验设计,标记的位置是至关重要的信息,需要被可靠的记录。这里的position该位置不是在时间点上给出的,而是在数据点中给出,这使得标记位置取决于采集时采样间隔。例如,如果在数据文件中标记的位置为1000,并且您的采样间隔为4毫秒(对应于250 Hz的采样率),则可以将标记的时间点计算为:
时间点[毫秒] =(数据点-1)*采样间隔[毫秒],或在例子中:(1000-1)* 4毫秒= 3996毫秒。
Marker可视化
在analyzer中,导入数据后,可查看如下界面

图2:Analyzer 2用户界面中的标记。主窗口中的显示是指导航栏(1)中突出显示的数据部分。标记导航工具(2)可用于跳转到特定标记。全局标记显示在所有通道下方或所有通道中的阴影区域(A)。通道标记显示为附加到特定通道(B)。
在Analyzer 2中编辑标记
在transformation下拉菜单中—Others —Edit Markers中,可编辑标记属性,如类型或描述,自动移动标记,创建新标记或删除不需要的标记等,Edit Markers有三种操作模式,分别是Automatic,Table和Graphical模式。具体的操作方法可参看《BP设备采集的数据修改Marker标记点》
Export in and out- 与外部软件编辑标记
在analyzer不满足我们修改marker的情况下,我们可以将marker信息文件通过export marker到第三方软件(例如:notebook或者Excel等)进行编辑。在Export >Export Markers可导出需要修改的marker信息,处理完后,可重新再次导入新的marker信息文件,在Transformations > Others > Import Markers 即可导入,前提是文件表头一定要对齐。
另一种方式是可以在Table模式下,直接复制marker信息,粘贴到Excel表格中进行修改。
第三种方法是在analyzer中由用户提供的solution方法可进行marker的导出与读取。在solution下拉菜单中即可使用。
这是bp设备中的marker信息的理解,我相信所有做事件相关任务的设备中都是需要做标记,对于脑电设备来说,neuroscan与bp的打marker方法是通过25针LPT并口进行传输,EGI的设备是通过网线进行传输,但是marker标记的意义是一样的。
主要参考:BP官网资料
文章仅限学习使用,不用于商业行为,若有侵权及疑问,请后台留言!
Make brain technology more simple!


IP属地:广东1楼2018-08-17 13:40回复
    请问你们是有在线的脑电系统吗?能不能给我发一个brainvision analyzer?最近特别纠结于怎么给放大器采集的脑电数据发送trigger,不同的脑电放大器的采集记录软件可以换吗?我用的是人家配套的采集记录软件,不知道这个能不能在我们的放大器上用


    2楼2018-10-27 14:08
    回复
      2026-01-18 20:18:38
      广告
      不感兴趣
      开通SVIP免广告
      请问哪里能下到这个软件啊,求告知


      3楼2018-11-24 17:39
      回复
        请问《E-prime主要常见问题及matlab、python打marker方式》在哪里看啊。。。我百度了没找到


        4楼2018-11-29 16:18
        回复