看了你的推论，
初始房间里的巨大的王冠骷髅没有在推论里
骷髅头上的王冠不是最终BOSS那个王的样式
骷髅腿边有个斩首斧
骷髅被枪插腹，整个游戏里用枪的只有城堡里的守卫
但骷髅边上的旗帜其他地方并没有发现
顺便一提，王城里有张“呐喊”

你永远不会知道这游戏玩了多少梗……2B都出现了

有些细节给楼主参考
巨大的王冠骷髅，武器商背后的巨剑
诅咒箱子和打破收费的门提到了众神，
除了中世纪鼠疫，或者还有一部分背景故事和（北欧）神话相关联
通关动画里，王如痴呆流口水，脸上有藤蔓似的斑纹
国王之手对战背景有个很多眼珠子的树

咳咳 游戏的制作者估计都没想到这么多

国王死了？也许没死，毕竟只是捅了一刀升天发白光，等主角钻出来国王不见了。要么国王有强大的能力(升天自爆)和主角同归于尽，要么是跑路了，因为王座后有一扇门过不去(0细胞)

个人认为山巅城堡的怪没有感染疫病（细胞四中被打了会有疫病应该只是为了提升难度），因为守护者的确做到了将疫病隔绝在时钟室外，细胞0中唯一会让你感染疫病的是门后的雕像，而树汁是疫病的根源，所以说带到山巅城堡中的雕像是被树汁浇灌过的。正如普通人感染了疫病变成强大的怪物一样，雕像在感染了疫病后也更加强大。那么是谁让雕像被感染的呢？极有可能是炼金术师，毕竟庇护所中有他的实验室。所以说炼金术士到底站在善还是恶的一边尚无定论。

我觉得主角极有可能就是炼金术士，有一个重要的细节。在时钟室后面的城堡之巅（不知道是不是这个名字）有一个炼金术士房间 房间里挂着一幅画像，画像的衣着和主角一模一样！区别是画像的头是人的头，而且戴着帽子。

我觉得，某种疫病爆发 人们陷入混乱，国王试着去治理，流程中有人被关着，并不是直接处死，到后面问题严重了，才处死，然后请到了炼金术士，还有活人的，就是流程里面要符文的胖子，还有个敲门被怪咬死的人，都是保持清醒可以正常说话有思想的人，说明离疾病爆发距离时间还是比较短的，就是末期 还有那么一小部分的人或者，游戏里有个金盾，招架怪可以出金币，说明说可以磕掉怪的金牙，说明这些怪都是人被感染发生变异的，至于庇护所我猜测是疫病爆发，保护剩下的人建造的，结果还是失败了，时间困不住的异变，庇护所也要完蛋，时钟塔的确是个谜团，不过我猜测是跟炼金术士闹翻后才找上他的，他就是个守护者，主角死后变成一坨球掉下来看样子是从下水道掉下来的一样，爬到一堆尸体，个人觉得是这团肉球自己组装的，毕竟尸体多的是 为什么同样的躯体，我觉得是游戏的手法，主角嘛，一直换很难有代入感，国王之手，挑衅 声音也很粗犷霸道，小怪都是人变得，他能召唤小怪我不觉得稀奇，毕竟将军就是将军，国王死了没错 被主角杀了，我认为二周目不能算进推理里面，我个人认为 国王还是有良心的，毕竟有想过治理，后面没办法才处刑，他自爆了最后，看起来像是要摧毁一切，而不是针对主角一个人，想要摧毁异变，士兵人民都变僵尸了这个光杆司令留着干嘛，以国王的气魄 有没有可能是国王下的一步棋？等着你来杀，然后自爆，国王跟炼金术士有矛盾个人非常赞同，因为要处死人民这个问题而闹矛盾也非常赞同，时间困不住异变，炼金术士知道。国王知不知道？不知道有可能在漫长等待过程中才知道，才有了主角杀国王自爆的戏码，至于收藏家那些人我倾向于是跟炼金术士一伙的，都是炼金术士的徒弟，或者跟班，看看他们的作用就知道了，都是炼金术用得上的。

打自己的脸

我更觉得新手妈妈是被皇室那一派的人杀了，主角第一次踢她的尸体的时候会掉落大剑，纵观整个游戏，好像只有山巅城堡的旋转哥是拿大剑的。而且看她有点像从城堡中出逃的研究人员，这也合理的解释被杀的原因。至于之前有人猜细胞是珍贵的资源的，我觉的也只是官方的小小恶意罢了，你用命去换细胞你不就会把身上的细胞都掉落吗

还有一个问题，就是在游戏过程中我们一直遇到的“神”是什么。游戏过程中可以看出，黄金门和诅咒宝箱其实就是“神”放在那里的，而且整个过程突出一个“等价交换”，黄金门要的钱越多诅咒数越多。但是，人家既然都是神了，那你惹恼了它（甚至一句之内诅咒次数达到数次），那他直接***不是更简单吗，为什么要给你设这么个诅咒？所以这个神可能是和别人做了一笔交易，不能直接弄死你，或者说仅仅是出于乐趣。那么，既然这个世界有“神”这么方便的存在，会不会一开始所有的东西都和神有关？假设这样一个剧情，国王之手并不是人（这点在剧情里也被明示过），而是由国王用神赐的汁液将国王之手造出来的，并且将这种汁液给了他的近卫军团使用。但这个神很明显遵循着等价交换，你获得了力量就要承担它的后果，即汁液带来了疫病。随后的剧情就如同以上猜想的那样，王国分为了国王派和炼金术士派，但是国王发现，被感染的人数太多，增加的太快，因此他启动了庇护所里的石像用以抵抗疫病，但是石像非但没有抵抗住疫病，甚至还被传染、冲出了庇护所，这也是为什么我们在庇护所外也能看到那个biubiubi的人的原因。眼看情形已经不受控制，国王又再次和神做了一笔交易，即以自身的灵智为代价，希望神将庇护所周围的时间永远固定在第一天以达到控制疫病的作用，因为只要杀光了最初的那一批感染者，疫病就可以得到控制。但是他忽略了庇护所上方是码头，疫病早已通过码头传染到岛上的各个地方。神与他达成了交易，将庇护所周围直到时钟塔的部分固定在了第一天爆发疫病的时间，但是对于外界来说，庇护所的开关早就已经打开了，所以即使不走庇护所，王城中的雕像依然会复活。而时光守护者本身其实并没有时间能力，就是一名“守护者”，守护时钟塔，清除进入其中的感染者。所以他只有空间系的能力而没有时间系的能力。然后就是主角的来历，从一周目的结尾我们可以得知，国王身后的水龙头实际上是直通游戏开始的地方的。因此，我们第一进入游戏的时候，很可能就是已经去到过国王之手，并从水龙头进入了。可能主角就是炼金术士想出的唯一可以对抗感染者的方法，所有的图纸都是炼金术士做出给主角的武器让其去对抗感染者。但是这时的国王已经失去了灵智，所以炼金术士和主角都被暴走的国王之手杀了。随后主角的本体通过水龙头逃走，但炼金术士没有想到，主角的记忆并不存在于那团绿色的细胞中，而是他寄生的身体上。那团细胞更像是一个算法，因此每次游戏遇到同样的剧情点他也只会说同样的话，而且一开始就懂得所有武器的用法。
然后是我对神的一个想法————一个等价交换、游戏中一直关注主角、什么地方都有他的影子的人，在游戏中会没有他的身影吗？不会。所以，一个在这种游戏中出现你绝对不会觉得奇怪、但是就是和剧情扯不上关系的人会是什么？对，就是收藏家。他可能就是背后与所有人做交易的“神”

话说楼主你就没想过那个到处都有的传送门是怎么回事吗(当然也可能仅仅为了游戏性)而且我发现传送门上的符号和时钟室背景里大表上的挺像

我比较想知道那些食物是谁搞出来的

其实有没有记得墓地的五细胞门，还有墓地的那尊雕像，以及墓地以前曾是最后一关，我个人认为墓地五细胞门后面肯定是去新地图的地方，因为死亡细胞出新地图不可能出在王座后面，再加上主角杀死国王的一段剧情，应该疫病的源头应该是有人想谋反制造出来的，因为源头是庇护所，而港湾建在庇护所的上方都不是殖民者选择的地方；而主角是炼金术师造出来的，这不难猜出来一些什么吧。

@Sundaland 楼主a测5细胞更了以及新boss（看起来是炼金术师的说，以及开场骷髅尸体活了...）