个人感觉，小初被救回来后，还是有一定问题的：
第一，小初被救的过程太过轻松，虽然寻找小初的过程比较曲折，但真正救出小初的过程只是跟萌萌哒的睡眠兽们打了一架，并没有太大危险，这不像利维坦的风格；
第二，小初已经被改造成了应用兽，却在被唤醒之后自行变了回来，这样说来，这种改造是不稳定的，很容易向本体退化，利维坦大费周章却只得到这样的结果，肯定是不能接受的；
第三，零跟小初是亲兄弟，二人相依为命那么久，零自身也是黑客，却丝毫不知道初的计算机才能，这不科学；
第四，关于制造启动兽的所有经历，都是小初的一面之词，且小初也无法控制启动兽，可以推测小初与启动兽的关系不足为信；
第五，也是最重要的一点，小初再明知道大空勇仁有问题的情况下，还让春和勇仁共同等待抓捕启动兽，且故意支开惠理和飞虎，这与正常人的逻辑相违背。
通过以上几点可分析出，现在的小初或为利维坦根据真实小初的记忆所复制出的机器人，目的之一就是找回失控的启动兽，另外可能还有其他目的。