故事发生在2029年，天网万万没想到，除掉一个人类的头领去给它带来更大的麻烦，现在它开始后悔是不是应该杀掉约翰。康纳了，这是当代看到自己的部队被一群群的机械章鱼和天空中飞行的喷火龙时所想到的事情，而现在这一切，都要归咎于2年前的一次行为。
当时是2027年，以约翰为首的人类反抗军成功地在绝对劣势的情况下，战胜了以数量和科技占据压倒性的机械人大军，并且杀入了天网的总部，当时天网虽然成功逃脱，并且将自己的部下送回过去，只是都以失败告终，最后，天网不得不自己亲自动手，它将自己输进一个超级机械人中，并且成功的回到过去，经过重重阻碍，最终干掉了它的死敌----约翰，也许它会获得胜利，但上天却跟它开了个相当大的玩笑，当它再回到未来时，却发现自己的军队却要面对一支比人类更难缠的敌人----机械母体，这支机械大军，主要以各种动物为模型而发展的机械大军，如果说天网的军队是机械人的话，那么它们就是机械兽了。不过，在这场战争中，机械兽占据优势，因为它们的数量比天网的多，但它们有个弱点，就是要吸收生物能源，而人类则是重要的能源，但是为什么人类并没有被消灭掉呢，最终天网才搞清楚：原因，当时的约翰无意中还制止了人类的另外一项计划----史密斯计划，人类通过史密斯计划，本来是要做一个与天网一样强大的电脑AI，只是被约翰破坏了，如今，约翰的消失让这计划得以实行，最后结果是，史密斯抢先一步打败人类并将他们放进一个容器作为能源，而当天网降临之时，人类已经变成了这些机械兽的营养剂了，这是天网的一时疏忽导致的，也就变成了这样的局面，但是，更混乱的事情还在后面，在一次大战中，它们无意中解开了一种古代生物----喷火龙的封印，结果是，大批的喷火龙开始攻击两支机械部队，让战事完全失控，不过，天网发现，喷火龙更喜欢攻击机械兽军，很可能是因为它们拿人类当养分导致的，因为喷火
龙非常人类这种食物，但是它们的繁殖能力太强了，也使两方军队无法消灭它们，也许这就是这个星球的未来了。
在某一银河，一群邪恶的异型突破了帝国军的防御，来到了我们的银河系，这群虫子相当残暴，他们喜欢将敌人分尸，而它们的首领则是吃高智商生物的脑酱为生，根它们作战的人，不付出巨大的牺牲根本无法抵抗它们的进攻，哪怕是宇宙最强的帝国军也恐惧它们三分，如今，这些家伙居然看上了一个不起眼的星球----地球，它们决定征服这个小星球，但它们并不知道，此时地球正是三大势力抢地盘之时，在毫无预

告下，异型们开始入侵地球，三方都受到这个突如其来的可怕外星种族非常猛烈的攻击，但更糟的是，帝国军也追到了地球，真正的混乱才开始。
邪恶的魔王撒旦控制了火龙，并且将自己的部队送入人世，这让人世更加混乱，但最混乱的不仅如此，在一万多年前，一群外星人与当时的文明展开了大战，最后是，文明沉入海底，并且继续发展，但是，地面的战争终于使这群外星侵略者再次苏醒，不过，这群外星人的对头，另外一个外星部队也来到了地球，他们是以空军为主的部队，有城市大的飞船和小型飞船，地球，已经变成了地狱星了。